用人单位不得随意对员工进行罚款，不配合工作不能直接作为罚款的合法依据，需分情况处理：
从劳动法角度分析：
- 根据我国现行劳动法律法规，用人单位并非行政机关，不具有行政处罚权，因此原则上不能对员工进行罚款。如果用人单位以员工不配合工作为由直接罚款，这种行为是违法的。员工有权拒绝这种不合理的处罚，并且可以向劳动监察部门投诉，要求用人单位纠正违法行为，返还被罚款项。
- 若员工的不配合工作行为给用人单位造成了经济损失，用人单位可以依据劳动合同的约定或者依法制定的规章制度，要求员工承担赔偿责任。但这种赔偿应当是合理的，且需要证明损失与员工行为之间的直接因果关系，赔偿金额也不能超过员工当月工资的20%，同时扣除后剩余工资不得低于当地最低工资标准。
从规章制度角度分析：
- 用人单位可以依法制定规章制度来规范员工的行为。如果规章制度中明确规定了不配合工作的具体情形以及相应的处理措施（如警告、记过、降职降薪等，但不包括罚款），并且这些规章制度已经经过民主程序制定、公示且告知了员工，那么用人单位可以依据这些规章制度对员工进行处理。
- 但需要注意的是，规章制度的内容必须合法合理，不能侵犯员工的合法权益。如果规章制度中的处理措施过于严苛或者不合理，员工有权提出异议，并可以通过法律途径维护自己的权益。
从实际操作角度建议：
- 对于员工不配合工作的情况，用人单位首先应当与员工进行沟通，了解原因并尝试解决问题。如果员工的行为确实违反了规章制度或者劳动合同的约定，用人单位可以依据相关规定进行处理，但应当确保处理措施的合法性和合理性。
- 如果用人单位认为员工的行为已经严重到需要解除劳动合同的程度，那么应当依据《劳动合同法》的相关规定，提前通知员工并支付经济补偿金（如果符合法定情形的话），然后依法解除劳动合同。
总结来说，不配合工作不能直接作为罚款的合法依据。用人单位应当依据劳动法律法规和依法制定的规章制度来处理员工的不配合工作行为，确保处理措施的合法性和合理性。如果员工对用人单位的处理措施有异议，可以通过法律途径维护自己的权益。如有更多疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。