结论前置：用工合同中，即使员工因机器操作违规导致工伤，用人单位一般仍需承担赔偿责任，但在特定情况下，用人单位的赔偿责任可能会减轻或免除。以下从不同角度进行详细分析：
一、用人单位的基本赔偿责任
根据《工伤保险条例》的相关规定，职工因工作遭受事故伤害或者患职业病进行治疗，享受工伤医疗待遇。这意味着，无论员工是否违规操作，只要是在工作过程中发生的伤害，员工都有权享受工伤保险待遇，用人单位需承担相应的赔偿责任。这是因为工伤保险制度的设计初衷就是为了分散用人单位的工伤风险，保障工伤职工的合法权益。
二、员工违规操作对赔偿责任的影响
虽然员工违规操作并不影响其享受工伤保险待遇的基本权利，但在某些情况下，员工的违规行为可能会对用人单位的赔偿责任产生影响。具体来说：
过错相抵原则：在民事赔偿中，如果受害人的过错与损害结果的发生或扩大存在因果关系，那么受害人的过错可以减轻或免除侵权人的赔偿责任。在工伤赔偿中，虽然这一原则并不直接适用，但法院在审理案件时，可能会考虑员工的过错程度，从而在一定程度上减轻用人单位的赔偿责任。不过，这种减轻通常不会完全免除用人单位的赔偿责任，因为工伤保险制度本身已经体现了对用人单位风险的一种分散。
用人单位的安全管理责任：如果用人单位能够证明其已经为员工提供了充分的安全培训、配备了必要的安全防护措施，并且员工明知违规操作可能带来的危险而仍然故意为之，那么用人单位在承担赔偿责任时可能会得到一定的减轻。但即便如此，用人单位仍需承担一定的赔偿责任，因为其作为劳动安全卫生的责任主体，有义务确保工作环境的安全。
三、特定情况下的免责或减轻责任
在极少数情况下，用人单位可能会因员工的严重违规行为而免除或减轻赔偿责任。这通常发生在员工故意自伤、自杀或者从事与工作无关的违纪违法行为等情形下。然而，这些情形都需要有充分的证据支持，并且需要经过严格的法律程序进行认定。
四、法律建议
对于用人单位：应加强员工的安全培训，确保员工熟悉操作规程和安全注意事项；同时，为员工配备必要的安全防护措施，降低工伤事故的发生概率。在发生工伤事故后，应积极配合员工进行工伤认定和赔偿申请工作，避免不必要的法律纠纷。
对于员工：应严格遵守操作规程和安全注意事项，避免违规操作带来的安全风险。如果发生工伤事故，应及时向用人单位报告并申请工伤认定和赔偿。
最后，用工合同中员工因机器操作违规导致工伤时，用人单位一般仍需承担赔偿责任。但具体责任大小可能会因员工的过错程度、用人单位的安全管理责任以及特定情况下的免责或减轻责任条款而有所不同。如果您有进一步的法律问题或需要更详细的法律建议，请直接向我咨询。