用人单位在终局裁决起诉被驳回后，申请撤销裁决的起算时间，应当自收到驳回起诉的裁定书之日起三十日内提出。以下是对这一问题的详细分析：
法律依据与起算时间
根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》第四十九条的规定，用人单位在收到终局裁决书后，如果认为该裁决存在法定撤销情形（如适用法律、法规确有错误，劳动争议仲裁委员会无管辖权，违反法定程序，裁决所根据的证据是伪造的，对方当事人隐瞒了足以影响公正裁决的证据，或者仲裁员在仲裁该案时有索贿受贿、徇私舞弊、枉法裁决行为等），可以在收到裁决书之日起三十日内向劳动争议仲裁委员会所在地的中级人民法院申请撤销裁决。若用人单位在此期间内选择了起诉但被法院驳回，其申请撤销裁决的起算时间则变为自收到驳回起诉的裁定书之日起三十日内。
申请撤销裁决的流程与注意事项
准备申请材料：用人单位在申请撤销裁决时，需要准备充分的证据材料，以证明裁决存在法定撤销情形。这些材料可能包括但不限于裁决书、起诉状、驳回起诉的裁定书、相关证据等。
提交申请：用人单位应在规定的期限内，向劳动争议仲裁委员会所在地的中级人民法院提交撤销裁决的申请书及相关证据材料。
法院审查：法院将对用人单位的申请进行审查，包括审查申请是否符合法定条件、证据是否充分等。如果法院认为申请符合法定条件且证据充分，将裁定撤销裁决；如果认为申请不符合法定条件或证据不足，将裁定驳回申请。
后续处理：如果裁决被撤销，用人单位和劳动者可以自收到裁定书之日起十五日内就该劳动争议事项向人民法院提起诉讼。如果裁决未被撤销，则裁决书自作出之日起发生法律效力，用人单位应当履行裁决书确定的义务。
风险提示与建议
及时行使权利：用人单位在收到驳回起诉的裁定书后，应尽快准备申请撤销裁决的材料并提交申请，以免错过法定的申请期限。
充分准备证据：申请撤销裁决需要充分的证据支持，用人单位应提前收集、整理相关证据材料，确保申请的成功率。
遵守法律程序：在申请撤销裁决的过程中，用人单位应严格遵守法律程序和规定，避免因程序不当而导致申请被驳回。
如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供详细的法律建议。