结论前置：在交通事故中，若对方保险公司已赔付务工费，公司单位是否还需赔偿，需分情况讨论，具体如下：
若务工费属于工伤保险赔偿范围，且符合工伤保险赔付条件：
- 根据《工伤保险条例》及相关规定，员工在上下班途中，受到非本人主要责任的交通事故伤害的，应认定为工伤。此时，员工可享受工伤保险待遇，包括停工留薪期工资（即务工费的一种形式）。
- 若对方保险公司已赔付了务工费，但该赔付金额低于工伤保险规定的停工留薪期工资标准，那么公司单位仍需补足差额部分。
- 若对方保险公司赔付的务工费已等于或超过工伤保险规定的标准，则公司单位无需再额外赔付务工费，但可能需配合员工办理工伤保险相关手续。
若务工费不属于工伤保险赔偿范围，或不符合工伤保险赔付条件：
- 在这种情况下，若对方保险公司已赔付了务工费，且该赔付是基于双方协商或法院判决等合法依据，那么公司单位通常无需再赔付务工费。
- 但需注意的是，如果公司单位与员工之间存在其他关于务工费的约定（如劳动合同中的特殊条款），且该约定不违反法律法规的强制性规定，那么公司单位仍需按照约定履行赔付义务。
特殊情况考虑：
- 如果交通事故是由第三方（非对方车辆驾驶员）造成的，且该第三方对事故负有责任，那么员工在获得对方保险公司赔付的同时，还可能向第三方主张赔偿。此时，公司单位的赔付责任需根据具体情况和法律法规进行判断。
- 另外，如果员工在交通事故中受伤后，因伤势严重导致长期无法工作，且该伤势与工作有关联（如职业病与交通事故共同作用），那么公司单位可能还需承担部分或全部的务工费赔付责任，具体需根据相关法律法规和实际情况进行判定。
建议：在处理此类问题时，建议员工先与对方保险公司和公司单位进行沟通协商，明确各自的赔付责任和金额。如果协商无果或存在争议，可以寻求法律援助或向相关部门投诉举报，以维护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。