当分公司负责人辞职后拒不交接分公司营业执照和公章、负责人章时，公司可以采取以下措施来维护自身权益：

1. 内部沟通与协商

   • 友好沟通：首先，尝试与离职的分公司负责人进行友好沟通，明确告知其有义务在离职时归还公司的营业执照、公章及负责人章。可以通过面谈、邮件或正式函件等方式进行，强调拒不交还的法律责任和职业道德问题。
   • 依据公司章程：如果公司章程中有关于离职交接的具体规定，应依据章程要求离职负责人履行相关义务。可以邀请第三方调解机构或行业前辈协助调解，促使双方达成一致意见。
   • 保留证据：在沟通过程中，务必保留好所有沟通记录、交接文件等相关证据，以备后续使用。

2. 发送催告函或律师函

   • 若内部沟通无果，公司可以委托律师向离职负责人发送催告函或律师函，正式要求其归还营业执照、公章及负责人章，并警告其若继续拒绝归还将承担法律责任。这种方式具有一定的法律威慑力，可能促使离职负责人主动履行义务。

3. 提起诉讼

   • 法律依据：根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，无权占有不动产或者动产的，权利人可以请求返还原物。公司作为营业执照、公章及负责人章的合法权利人，有权要求离职负责人返还这些物品。同时，若离职负责人的行为涉嫌构成侵占罪（根据《中华人民共和国刑法》第二百七十条的规定，将代为保管的他人财物非法占为己有，数额较大，拒不退还的，构成侵占罪），公司还可以向公安机关报案，由公安机关依法立案侦查。
   • 诉讼准备：
     • 收集证据：包括离职负责人的身份信息、离职证明、公司营业执照、公章及负责人章的使用记录、催告函或律师函的发送记录等，以证明离职负责人无权占有且经催告仍不归还的事实。
     • 确定诉讼请求：明确要求离职负责人立即归还营业执照、公章及负责人章，并可能主张因延迟归还给公司造成的损失赔偿。
   • 诉讼流程：
     • 向有管辖权的人民法院提交起诉状及相关证据材料。
     • 法院受理案件后，会依法进行审理。在审理过程中，公司需配合法院的调查取证工作，提供必要的协助。
     • 若法院最终判决支持公司的诉讼请求，而离职负责人仍不履行判决义务，公司可申请强制执行，由法院采取查封、扣押、拍卖等措施强制其履行。

4. 挂失补办与变更登记

   • 挂失补办：为避免营业执照、公章及负责人章缺失影响公司正常运营，公司可向工商行政管理部门申请挂失，并补办营业执照。对于公章，需向公安机关备案后重新刻制。但需注意，挂失补办不能替代对原持有人拒绝交还行为的追究。
   • 变更登记：当分公司营业执照上的负责人辞职时，需依法进行变更登记，包括领取《公司变更登记申请表》，填写完公司变更表格后，加盖公司公章（此时可使用新刻制的公章），并整理相关材料前往工商局办证大厅办理。除了营业执照外，还需变更组织机构代码证、税务登记证以及银行信息等，确保公司经营的合法性和连续性。

在处理此类问题时，公司应注意以下几点：

• 及时处理：尽快处理离职负责人拒绝交还营业执照、公章及负责人章的问题，以避免对公司运营造成不必要的影响。
• 综合施策：在处理过程中，应综合运用内部沟通、法律途径和挂失补办等多种手段，确保问题得到有效解决。
• 预防机制：建议公司在员工入职时即明确营业执照、公章及负责人章的使用和管理规定，并在离职时进行严格的交接手续，以预防类似问题的发生。

如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。