员工违规操作受伤，公司一般不能拒绝赔偿，但仍需承担相应的工伤保险赔偿责任。不过，在特定情况下，公司可能享有有限的追偿权。以下从不同角度详细分析：
从工伤保险的角度
无过错补偿原则：
- 含义：工伤保险遵循无过错责任补偿原则，即无论事故责任归属，只要员工在工作时间、工作场所内因工作原因受伤或患职业病，均依法享受工伤保险待遇。这意味着，即使员工存在违规操作，只要符合工伤认定的条件，公司仍需承担相应的赔偿责任。
- 法律依据：《工伤保险条例》第十四条明确规定，职工在工作时间和工作场所内，因工作原因受到事故伤害的，应认定为工伤。这表明工伤认定主要考量的是工作时间、地点和原因，而非员工过错。
公司的工伤保险责任：
- 缴纳工伤保险的情况：若公司已为员工缴纳工伤保险，则员工发生工伤后，大部分赔偿费用（如医疗费、伤残津贴等）由工伤保险基金支付，公司仅需承担补充责任，如停工留薪期工资。
- 未缴纳工伤保险的情况：若公司未依法缴纳工伤保险，则需按照《工伤保险条例》第六十二条的规定，自行承担全部的工伤赔偿责任，不能因为员工违规操作而免除或减轻责任。
从民事侵权与内部管理角度
一般情况下公司难以拒绝赔偿：
- 劳动关系的特殊性：公司对员工负有管理、监督和提供安全保障的职责。员工违规操作受伤往往也反映出公司在管理、培训或安全保障上的不足。因此，公司不能简单地将责任全部归咎于员工。
- 风险与利益的平衡：员工为公司创造利益的同时承担工作风险，因此不能仅因一次违规操作就将全部风险和损失转嫁给员工。
特殊情况下的处理：
- 员工故意或重大过失：若员工故意破坏生产设备导致自己受伤，或严重违反操作规程且明知可能造成伤害后果仍执意为之，并给公司造成重大经济损失，公司在承担工伤赔偿责任后，可根据具体情况通过法律途径向员工进行适当追偿。但需考虑员工的经济状况和过错程度，且追偿范围通常限于公司实际遭受的损失，并需依法进行。
- 双方有明确约定：若劳动合同或其他合法有效的协议中明确规定了员工因故意或重大过失给公司造成损失的赔偿问题，且不违反法律法规强制性规定，公司可依据约定要求员工承担相应责任。但此类约定需严格符合法律规定，且不得免除公司的法定工伤赔偿责任。
内部处罚措施：虽然公司不能因员工违规操作受伤而拒绝赔偿损失，但可根据公司规章制度对员工进行纪律处分、扣发奖金等处罚。前提是必须有充分证据证明员工的过错程度，且处罚措施需符合法律法规和公司规章制度的规定。
总结与建议
员工违规操作受伤时，公司应遵循无过错补偿原则承担工伤保险赔偿责任。在大多数情况下，公司不能拒绝赔偿。然而，在员工存在故意或重大过失且给公司造成重大损失的情况下，公司可能享有有限的追偿权，并且必须依法进行。同时，公司可通过内部管理制度对员工进行适当处罚，但不能以此完全免除自身的法定工伤赔偿责任。
建议公司在日常管理中加强安全培训、完善规章制度，并确保为员工缴纳工伤保险，以降低工伤风险和法律纠纷。若遇到具体案例或疑问，可直接向我咨询，我将根据具体情况提供详细的法律建议。