结论前置：侵犯著作权三年后能否起诉，需分情况讨论。一般情况下，若自权利人知道或应当知道权利受损及义务人之日起超过三年，且不存在诉讼时效中止、中断等特殊情形，则可能丧失胜诉权；但若侵权行为在起诉时仍在持续，且著作权未过期，则仍可起诉要求停止侵权，并就起诉前三年内的损失主张赔偿。
详细分析如下：
根据《中华人民共和国民法典》第一百八十八条，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间通常为三年。这一规定同样适用于著作权侵权纠纷。诉讼时效期间自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。这意味着，如果著作权人明确知道自己的权利被侵犯，并且知道侵权人是谁，那么从这一天起三年内，他们有权向法院提起诉讼。
超过诉讼时效期间的起诉处理
一般情形：如果著作权人自知道或应当知道权利受损及义务人之日起超过三年才提起诉讼，且不存在诉讼时效中止、中断等特殊情形，那么他们可能会丧失胜诉权。也就是说，法院可能不再支持他们的诉讼请求，除非侵权人自愿履行义务。
侵权行为持续的情形：然而，如果著作权侵权行为在起诉时仍在持续，并且该著作权的保护期尚未届满，那么根据《最高人民法院关于审理著作权民事纠纷案件适用法律若干问题的解释》第二十七条，人民法院仍应判决被告停止侵权行为。对于侵权损害赔偿数额的计算，则是从权利人向人民法院起诉之日起向前推算三年进行计算。这意味着，即便超过了三年的诉讼时效，只要侵权行为仍在继续，权利人仍有权要求法院制止侵权行为，并就起诉前三年内的损失主张赔偿。
诉讼时效的中止与中断
诉讼时效中止：在诉讼时效期间的最后六个月内，如果因法定障碍（如不可抗力等）导致权利人无法行使请求权，诉讼时效将中止。自中止时效的原因消除之日起满六个月，诉讼时效期间届满。这意味着，如果权利人因不可抗力等原因无法在诉讼时效期间内提起诉讼，那么他们可以在障碍消除后的六个月内提起诉讼，而不会丧失胜诉权。
诉讼时效中断：权利人向义务人提出履行请求、义务人同意履行义务、权利人提起诉讼或者申请仲裁等行为，都会导致诉讼时效的中断。从中断时起，诉讼时效期间重新计算。这意味着，如果权利人在诉讼时效期间内采取了积极行动来维护自己的权益，那么他们可以重新获得三年的诉讼时效期间。
特殊情况的考量
在实际应用中，还可能存在其他特殊情况影响诉讼时效的判定，如权利人的认知能力受限、义务人故意隐瞒侵权事实等。这些情况需要结合具体案件事实和法律规定进行综合判断。例如，如果权利人因年龄、精神状况等原因无法及时知道自己的权利被侵犯，那么诉讼时效的起算点可能会相应推迟。
作为著作权权利人，应密切关注自己的权利状况，一旦发现侵权行为，应及时采取措施并通过法律途径维护自身权益。同时，保留好相关证据至关重要，以便在诉讼过程中提供充分证明支持自己的主张。即使面临诉讼时效的限制，也应注意是否存在中止、中断等特殊情况，以确保自身权益得到充分保护。
总结来说，侵犯著作权三年后能否起诉并不是一个简单的是非问题，而是需要根据具体情况进行综合判断。如果你面临这样的法律问题，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供详细的法律建议。