您好，关于您提出的“进了禁区后再办通行证是否会受到处罚”的问题，这主要取决于具体的禁区管理规定以及您进入禁区的具体情况。不过，我可以根据一般的边境管理区通行证管理办法来给您一个大致的解答。

首先，需要明确的是，在进入边境管理区（或类似禁区）之前，通常是需要提前办理好相应的通行证件的。这是为了维护边境管理区的治安秩序，确保人员进出有序。如果您在没有办理通行证的情况下进入了禁区，这本身可能就已经违反了相关规定。

对于您提到的“进了禁区后再办通行证”的情况，一般来说，这并不能免除您之前未持证进入禁区的违规责任。因为通行证的作用是在您进入禁区之前进行验证和许可，而不是在您已经违规进入后作为补救措施。

具体来说，如果您未持有效通行证进入了边境管理区，边防公安检查站或铁路公安部门有权阻止您进入，并可能根据情节给予警告、罚款等处罚。即使您后来补办了通行证，这也不能改变您之前未持证进入的事实，因此您仍然可能需要承担相应的违规责任。

当然，具体的处罚措施会因地区、具体情况以及相关法律法规的不同而有所差异。例如，在某些特殊情况下，如紧急公务、医疗救助等，可能存在一定的豁免或特殊处理机制。但一般来说，未持证进入禁区是违规行为，需要承担相应的责任。

因此，我建议您在进入任何禁区或边境管理区之前，务必提前了解并办理好相应的通行证件，以避免不必要的麻烦和违规责任。如果您已经进入了禁区且未办理通行证，我建议您尽快与相关部门联系并说明情况，以便尽快解决问题并减少可能的损失。