连续进入两个禁行区域的处罚通常为分别处罚后合并执行，具体处罚措施需根据禁行区域类型及地方规定确定。以下从不同角度详细说明：

1. 处罚原则
   根据《行政处罚法》第二十九条，对当事人的同一个违法行为，不得给予两次以上罚款的行政处罚。但若进入两个禁行区域属于两个独立的违法行为（如分别在不同时间、路段进入），则可能面临分别处罚后合并执行的结果。例如：第一次进入禁行区域罚款200元、记3分，第二次进入可能再次罚款200元、记3分，最终合并执行罚款400元、记6分。

2. 禁行区域类型的影响

   • 道路禁行（如货车限行、单双号限行）：通常按“违反禁令标志指示”处罚，罚款100-200元、记3分（部分地区可能不记分）。若两次进入不同禁行路段，可能按两次违法行为处理。
     
   • 区域禁行（如环保限行区、赛事临时管制区）：处罚力度可能更严格，例如罚款200-500元、扣车，甚至行政拘留（如严重扰乱秩序）。若两次进入同一区域的不同时段，可能按连续违法行为加重处罚。

3. 地方性规定的差异
   不同城市对禁行区域的处罚标准可能不同。例如：

   • 北京市对货车违反五环内禁行规定，罚款100元、记3分；若连续两天进入，可能按两次处罚合并执行。
     
   • 上海市对外牌车违反高架禁行规定，罚款200元、记3分；若同一路段多次违规，可能被认定为“屡教不改”，面临更高罚款或暂扣驾驶证。

4. 特殊情形

   • 同一路段连续行驶：若在禁行区域内被连续抓拍（如电子眼间隔拍摄），可能被认定为一次违法行为，按最高标准处罚（如罚款200元、记3分）。
     
   • 紧急避险或特殊许可：若因救护、消防等紧急情况进入禁行区域，可免于处罚，但需提供证明材料；若持有临时通行证，需按许可路线行驶，否则仍可能被处罚。

建议：若您已因连续进入禁行区域收到处罚通知，可核对处罚依据（如《道路交通安全法》第38条、第90条）及地方细则，确认处罚是否合理。如有疑问，可直接向我咨询具体案例的应对方案。