在确定仲裁条款无效后，案件的管辖权通常归属于人民法院，具体由哪个法院管辖需根据案件性质和法律规定来确定。以下是对此问题的详细分析：
一、仲裁条款无效的法律后果
仲裁条款是当事人之间约定将争议提交仲裁解决的协议。当仲裁条款被认定为无效时，意味着当事人之间没有有效的仲裁协议，因此无法通过仲裁方式解决争议。此时，案件将进入诉讼程序，由人民法院进行管辖。
二、管辖法院的确定
一般原则：
- 根据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，对公民提起的民事诉讼，由被告住所地人民法院管辖；被告住所地与经常居住地不一致的，由经常居住地人民法院管辖。
- 对法人或者其他组织提起的民事诉讼，由被告住所地人民法院管辖。同一诉讼的几个被告住所地、经常居住地在两个以上人民法院辖区的，各该人民法院都有管辖权。
特殊情形：
- 如果案件涉及合同纠纷，且合同中有约定管辖法院的条款，且该条款不违反级别管辖和专属管辖的规定，那么应按照合同约定来确定管辖法院。但需注意，由于仲裁条款已无效，因此合同中关于仲裁的约定不再适用，仅考虑其他管辖约定。
- 如果案件涉及侵权纠纷，如劳动工伤纠纷中因用人单位侵权导致的损害赔偿等，那么通常由侵权行为地或者被告住所地人民法院管辖。
三、劳动工伤纠纷中的管辖权问题
在劳动工伤纠纷中，如果仲裁条款被认定为无效，且双方未就管辖法院达成其他约定，那么通常按照以下原则确定管辖法院：
- 被告住所地：即用人单位的注册地或主要办事机构所在地。如果用人单位的注册地与实际经营地不一致，且能够证明实际经营地的，以实际经营地为准。
- 劳动合同履行地：即劳动者实际提供劳动的地点。在劳动工伤纠纷中，劳动合同履行地往往与工伤事故发生地一致，因此也可以作为确定管辖法院的依据。
具体来说：
- 如果用人单位和劳动者分别向劳动合同履行地和用人单位所在地的劳动争议仲裁委员会申请仲裁的，由劳动合同履行地的劳动争议仲裁委员会管辖。这一原则在仲裁阶段适用，当仲裁条款无效进入诉讼阶段时，同样可以参照此原则，即由劳动合同履行地或用人单位所在地的人民法院管辖。
- 在多个法院都有管辖权的情况下，原告可以选择向其中一个人民法院提起诉讼。如果原告向两个以上有管辖权的人民法院提起诉讼的，由最先立案的人民法院管辖。
四、法律建议
- 在签订劳动合同时：建议双方明确约定管辖法院，以避免未来可能出现的管辖权争议。但需注意，约定的管辖法院应不违反级别管辖和专属管辖的规定。
- 在仲裁条款被认定为无效后：应及时向有管辖权的人民法院提起诉讼，并准备好相关证据材料以支持自己的主张。
- 在诉讼过程中：应积极配合法院的审理工作，遵守诉讼程序的规定，以维护自己的合法权益。
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