结论：舅舅能否代替小孩签订关于邻居建房的协议，需视具体情况而定，主要取决于小孩的民事行为能力以及舅舅是否获得合法有效的代理权。
分析如下：
小孩的民事行为能力：
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，民事行为能力是指民事主体以自己独立的行为享有民事权利、承担民事义务的资格。
- 若小孩为无民事行为能力人（如不满8周岁的未成年人），则其无法独立进行民事法律行为，包括签订协议。此时，若需签订协议，应由其法定代理人（如父母）代为进行。
- 若小孩为限制民事行为能力人（如8周岁以上但不满18周岁的未成年人，且不能完全辨认自己行为的），则其进行的民事法律行为效力待定，需经其法定代理人同意或追认后才有效。在此情况下，舅舅若非法定代理人，则无权直接代替小孩签订协议。
- 若小孩为完全民事行为能力人（如已满18周岁的成年人），则其有权独立签订协议，无需他人代理。
舅舅的代理权：
- 即便小孩为无民事行为能力人或限制民事行为能力人，舅舅若想代替其签订协议，也需获得合法有效的代理权。
- 代理权通常来源于法定代理（如父母作为法定代理人）或意定代理（如小孩通过书面或口头方式授权舅舅作为其代理人）。
- 若舅舅未获得合法有效的代理权，则其代替小孩签订的协议可能因无权代理而无效。
法律建议：
- 若小孩为无民事行为能力人或限制民事行为能力人，且舅舅希望代替其签订关于邻居建房的协议，建议先确认小孩的法定代理人（如父母）是否同意或授权舅舅进行代理。
- 若舅舅获得合法有效的代理权，应在签订协议时明确表明代理身份，并保留好相关授权文件，以备不时之需。
- 若对小孩的民事行为能力或舅舅的代理权存在疑问，建议咨询专业律师，以确保协议的合法性和有效性。
可能法律后果：
- 若舅舅在未获得合法有效代理权的情况下代替小孩签订协议，且该协议因无权代理而无效，则可能引发纠纷和损失。例如，邻居可能因协议无效而拒绝履行相关义务，导致小孩或其家庭遭受经济损失。
- 若舅舅在签订协议时存在欺诈、胁迫等违法行为，还可能承担相应的法律责任。
因此，在处理此类问题时，务必谨慎行事，确保所有法律行为均合法有效。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。