协议只签字没盖章，五年后起诉是否有效，这主要取决于协议的性质、内容以及相关法律法规的规定，但通常情况下，只要协议内容合法且双方意思表示真实，即使未盖章，协议也可能被认定为有效。以下从不同角度进行分析：
一、协议的有效性判断
合同成立的要件：
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，合同成立一般需要具备要约和承诺两个阶段，且双方意思表示真实、一致。在协议上签字，通常被视为对协议内容的认可和承诺，是合同成立的重要标志。
- 盖章并非合同成立的绝对要件，尤其是在双方已经实际履行协议主要义务的情况下，未盖章的协议也可能被认定为有效。
协议内容的合法性：
- 协议内容必须合法，不得违反法律、行政法规的强制性规定，不得违背公序良俗。如果协议内容违法，即使双方签字盖章，协议也可能被认定为无效。
双方的意思表示：
- 双方必须在平等、自愿的基础上签订协议，且意思表示真实。如果一方存在欺诈、胁迫等情形，导致另一方在违背真实意思的情况下签订协议，该协议可能被撤销或认定为无效。
二、五年后起诉的效力问题
诉讼时效：
- 根据《中华人民共和国民法典》的规定，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。但是，自权利受到损害之日起超过二十年的，人民法院不予保护，有特殊情况的，人民法院可以根据权利人的申请决定延长。
- 如果协议中约定了履行期限，诉讼时效期间通常从履行期限届满之日起计算。如果协议未约定履行期限，诉讼时效期间可能从协议成立之日起计算，或者从权利人知道或应当知道权利受到损害之日起计算。
- 因此，五年后起诉是否超过诉讼时效，需要根据具体情况进行判断。如果未超过诉讼时效，且协议内容合法、双方意思表示真实，起诉是有效的。
证据的保存与提供：
- 在起诉时，原告需要提供充分的证据证明协议的存在、内容以及双方的权利义务关系。如果协议未盖章，原告可能需要提供其他证据（如履行协议的凭证、双方沟通记录等）来证明协议的真实性和有效性。
三、建议与风险提示
建议：
- 在签订协议时，尽量确保双方签字并盖章，以增加协议的法律效力和可执行性。
- 如果协议未盖章，但双方已经实际履行协议主要义务，且协议内容合法、双方意思表示真实，可以考虑通过补充协议、确认函等方式对原协议进行确认和补充。
- 在起诉前，务必收集并保存好与协议相关的所有证据，以便在诉讼中提供充分的证明。
风险提示：
- 如果协议未盖章且存在争议，可能会增加诉讼的复杂性和不确定性。
- 如果超过诉讼时效期间起诉，可能会面临被法院驳回起诉的风险。
综上所述，协议只签字没盖章五年后起诉是否有效，需要根据具体情况进行判断。如果您面临类似问题，建议直接向我咨询，以便根据您的具体情况提供更准确的法律建议。