结论：若判决书中仅判定还款按工程款利息计算，而未将判项违约滞纳金写入判决内，那么在一般情况下，违约滞纳金将无法直接依据该判决书进行计算和主张。不过，具体能否主张及如何计算，还需结合合同约定、实际损失情况以及法律规定等多方面因素进行综合判断。以下从几个角度进行详细分析：
一、合同约定角度
合同中有明确约定违约滞纳金：
- 如果双方在合同中明确约定了违约滞纳金的计算方式和标准，那么即使判决书未提及，受损方仍有权依据合同约定向违约方主张违约滞纳金。此时，违约滞纳金的计算应严格按照合同约定执行。
- 计算公式示例（假设合同约定滞纳金为每日万分之五）：
- 滞纳金 = 逾期未还款金额 × 每日滞纳金率 × 逾期天数
- 例如：逾期未还款金额为100万元，每日滞纳金率为万分之五，逾期天数为30天，则滞纳金 = 100万 × 0.0005 × 30 = 1.5万元。
合同中未约定违约滞纳金或约定不明确：
- 如果合同中未约定违约滞纳金或约定不明确，那么受损方将难以直接依据合同主张违约滞纳金。此时，受损方可能需要通过其他途径来寻求救济，如主张实际损失赔偿等。
二、法律规定角度
法定违约金或滞纳金：
- 在某些特定情况下，法律可能规定了违约金或滞纳金的计算方式和标准。如果双方之间的合同关系属于法律规定的特定类型，且法律对违约金或滞纳金有明确规定，那么受损方可以依据法律规定主张违约滞纳金。
- 然而，在大多数建设工程合同纠纷中，法律并未直接规定违约滞纳金的计算方式和标准，因此这一途径可能并不适用。
实际损失赔偿：
- 如果合同中未约定违约滞纳金，且法律也未规定相关标准，那么受损方可以主张实际损失赔偿。实际损失赔偿的范围应限于因违约行为所造成的直接损失和合理可预见的间接损失。
- 在主张实际损失赔偿时，受损方需要提供充分的证据证明其实际损失的大小和计算方式。
三、判决书执行与补充判决角度
判决书执行：
- 判决书是法院对案件审理后作出的具有法律效力的文书。如果判决书未提及违约滞纳金，那么在执行阶段，法院将不会依据判决书对违约滞纳金进行强制执行。
补充判决或另行起诉：
- 如果受损方认为违约滞纳金应当得到支持，但判决书未予涉及，那么受损方可以考虑向法院申请补充判决或另行起诉主张违约滞纳金。不过，这需要满足一定的条件，如原判决存在遗漏、错误等情形。
- 在申请补充判决或另行起诉时，受损方需要提供充分的证据证明其主张违约滞纳金的合理性和合法性。
建议：针对您的情况，我建议您首先仔细审查合同条款，看是否有关于违约滞纳金的明确约定。如果有约定，您可以依据合同约定向违约方主张违约滞纳金；如果没有约定或约定不明确，您可以考虑主张实际损失赔偿或向法院申请补充判决/另行起诉。在处理此类纠纷时，务必保留好相关证据，以便在需要时提供证明。如果您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。