合同中约定的欠款5000元逾期二年，违约金的数额并非固定，而是取决于合同中的具体约定以及法律的相关规定。以下从不同角度进行分析：

一、合同有明确约定违约金的情况

如果合同中明确约定了逾期违约金的计算方式，比如“逾期每日按欠款金额的千分之五计算违约金”，那么违约金的数额就可以按照合同约定来计算。

计算公式：违约金 = 欠款金额 × 逾期天数 × 每日违约金率

示例计算：假设合同约定逾期每日按欠款金额的千分之五计算违约金，那么逾期二年的违约金计算如下：

• 欠款金额：5000元
• 逾期天数：2年 × 365天/年 = 730天（为简化计算，这里不考虑闰年）
• 每日违约金率：0.5%（即千分之五）

违约金 = 5000 × 730 × 0.5% = 18250元

但需要注意的是，根据《民法典》的相关规定，如果约定的违约金过分高于造成的损失的，人民法院或者仲裁机构可以根据当事人的请求予以适当减少。因此，即使合同中有明确约定，如果违约金数额过高，也可能被法院或仲裁机构调整。

二、合同未约定违约金或约定不明确的情况

如果合同中未约定违约金或约定不明确，那么根据《民法典》的相关规定，当事人可以主张因违约造成的损失赔偿。在这种情况下，违约金的数额将取决于债权人因违约所遭受的实际损失。

• 实际损失的计算：这通常包括因违约导致的直接经济损失（如利息损失、额外费用支出等）以及可能的间接经济损失（如因违约导致的商业机会丧失等）。然而，间接经济损失往往难以准确计算，且需要债权人提供充分的证据来证明。
• 法院或仲裁机构的裁量权：在合同未约定违约金或约定不明确的情况下，法院或仲裁机构将根据案件的具体情况，包括违约方的过错程度、债权人的实际损失等因素，来裁量违约金的数额。

三、法律对违约金数额的限制

无论合同中是否有明确约定，违约金的数额都受到法律的限制。根据《民法典》的相关规定，如果约定的违约金低于造成的损失的，人民法院或者仲裁机构可以根据当事人的请求予以增加；如果约定的违约金过分高于造成的损失的，人民法院或者仲裁机构可以根据当事人的请求予以适当减少。

建议：

1. 审查合同条款：首先审查合同中关于违约金的约定，明确违约金的计算方式和数额。
2. 评估实际损失：如果合同未约定违约金或约定不明确，评估因违约造成的实际损失，以便在主张损失赔偿时有充分的依据。
3. 咨询专业律师：在处理涉及违约金的问题时，建议咨询专业律师，以便更好地了解自己的权利和义务，并制定合理的维权策略。

如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。