结论：在公司申请破产的情况下，您已提交但未获得支付的6000元报销，其处理方式主要取决于该报销款项的性质以及破产财产的分配顺序。以下是从不同角度为您详细分析的情况及建议：
一、报销款项性质与破产财产分配
若报销款项属于职工债权：
- 法律背景：根据《中华人民共和国企业破产法》的相关规定，职工债权（包括工资、医疗、伤残补助、抚恤费用，所欠的应当划入职工个人账户的基本养老保险、基本医疗保险费用，以及法律、行政法规规定应当支付给职工的补偿金等）在破产财产分配中享有优先受偿权。
- 建议：您应尽快向破产管理人申报您的报销债权，并提供相关证据（如报销单、审批流程记录等），以证明该款项属于职工债权范畴。在破产财产分配时，您的报销债权将优先于其他普通债权得到清偿。
若报销款项不属于职工债权：
- 法律背景：若报销款项被认定为普通债权，则其清偿顺序将排在职工债权之后。在破产财产不足以清偿全部债务的情况下，普通债权可能无法得到全额清偿。
- 建议：同样，您应向破产管理人申报债权，并提供相关证据。虽然普通债权的清偿顺序较后，但您仍有权参与破产财产的分配，并按照法定顺序获得清偿。
二、破产管理人的角色与责任
- 法律背景：破产管理人负责破产财产的保管、清理、估价、处理和分配等工作。他们有义务接收债权人的债权申报，并对申报的债权进行审查、确认。
- 建议：您应积极与破产管理人沟通，了解破产程序的进展情况，以及您的报销债权是否已被确认。若破产管理人未予确认或您对其确认结果有异议，您可以依法向人民法院提起诉讼或申请仲裁。
三、后续行动建议
- 及时申报债权：无论报销款项是否属于职工债权，您都应尽快向破产管理人申报债权，并提供相关证据。
- 关注破产程序进展：了解破产财产的分配情况，以及您的报销债权在分配中的位置。
- 寻求法律援助：若您在破产程序中遇到任何问题或困难，如破产管理人未予确认债权、破产财产分配不公等，您可以向我咨询，我将根据您的具体情况提供专业的法律建议。
最后，公司破产是一个复杂且漫长的过程，涉及多方利益和法律程序。您在此过程中应保持耐心和理性，积极维护自己的合法权益。若您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。