结论：电动车被盗价值3900元，一般情况下是可以立案的，但具体还需考虑地区经济发展水平及是否存在特殊盗窃情形。

分析说明：

1. 价值标准：

   • 根据相关法律法规及实践，被盗电动车的价值达到人民币1000元至3000元及以上时，公安机关通常会予以立案。这一标准可能因地区经济发展水平差异而有所调整，经济发达地区立案标准可能稍高，经济欠发达地区则可能稍低。但您提到的电动车价值3900元，已经超出了这一大致范围的下限，因此在大多数情况下，是可以达到立案标准的。

2. 特殊情形：

   • 即使电动车价值未达到上述标准，如果存在多次盗窃（两年内盗窃行为超过三次以上）、入户盗窃、携带凶器盗窃、扒窃等情形，公安机关也应当立案追诉。不过，在您的情况下，由于电动车价值已经较高，这一特殊情形可能不是主要考虑因素，但如果存在这些特殊情形，将进一步支持立案的决定。

法律后果与建议：

• 如果盗窃金额较小，即属于“数额较大”的情况，罪犯将面临三年以下有期徒刑、拘役或管制，并处罚金。在您的情况下，由于电动车价值3900元，如果构成犯罪，将可能面临这一层次的刑事处罚。
• 建议：您应及时向当地公安机关报案，并提供尽可能详细的证据和信息，如电动车的购买发票、型号、颜色、特征等，以及被盗的时间、地点和可能的情况等。这些信息将有助于公安机关尽快立案并展开调查，追回您的损失。

特殊情况说明：

• 需要注意的是，不同地区的经济发展状况会影响具体的立案金额范围。因此，虽然您提到的电动车价值3900元在大多数情况下可以达到立案标准，但具体还需以当地公安机关的判断为准。
• 另外，如果公安机关认为证据不足或不符合立案条件，您可以要求其出具不予立案通知书，并可以向上一级公安机关申请复议或向人民检察院提出立案监督申请。

行动建议：

• 立即报案：尽快向当地公安机关报案，并提供详细证据和信息。
• 保留证据：妥善保管与电动车相关的所有证据和信息，以备后续需要。
• 咨询律师：如有需要，您可以向我咨询相关法律问题，我将根据您的具体情况提供进一步的法律建议和帮助。