结论：该情况是否合法不能一概而论，需分情况讨论，主要看发票金额与实际缴费金额不一致的原因是否合理合法。具体分析如下：

1. 若存在计算错误或系统失误等合理原因
   如果物业公司因计算错误、系统录入失误或发票开具时的四舍五入规则等合理原因，导致发票金额与实际缴费金额存在小额差异（如您实际缴纳3900元，因税率计算或小数点取舍导致发票显示3600多元，税款200多元），且物业公司能够提供证据证明实际收费金额为3900元（如收款凭证、缴费通知单等），则该行为可能不构成违法。但物业公司应及时更正发票，确保发票金额与实际缴费金额一致，以避免后续纠纷。

2. 若存在故意少开发票、偷逃税款等违法行为
   如果物业公司故意少开发票金额（如实际收取3900元，但仅开具3600多元的发票，意图通过“少报收入”偷逃税款），则该行为违反了《中华人民共和国发票管理办法》和《中华人民共和国税收征收管理法》的相关规定。根据《发票管理办法》第二十二条，开具发票应当按照规定的时限、顺序、栏目，全部联次一次性如实开具，并加盖发票专用章。任何单位和个人不得有下列虚开发票行为：……（三）介绍他人开具与实际经营业务情况不符的发票。若物业公司存在此类行为，税务机关可责令其改正，并处以罚款；情节严重的，还可能构成逃税罪，需承担刑事责任。

建议：

• 您可先与物业公司沟通，要求其提供收费明细和发票开具依据，核实是否存在计算错误或系统失误；
  
• 若物业公司拒绝更正或无法提供合理解释，您可向当地税务机关举报（如拨打12366纳税服务热线），由税务机关调查处理；
  
• 同时，您可保留缴费凭证、发票等证据，以备后续维权使用。
  

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