结论前置：委托第三方付款但发票开给委托人时，一般建议备注说明情况，但具体是否必须备注需结合交易性质、行业惯例及税务要求综合判断。以下分情况详细说明：

1. 从税务合规角度

• 增值税发票管理要求：根据《增值税发票开具指南》，发票内容应与实际交易相符。若委托第三方付款但合同主体为委托人与收款方，发票直接开给委托人符合“三流一致”（资金流、发票流、货物流）原则，通常无需强制备注付款方信息。但若税务机关质疑交易真实性（如付款方与发票方不一致），备注“委托XX公司付款”可辅助证明业务合理性，降低税务风险。
• 特殊行业或交易：如建筑服务、差额征税等场景，税务机关可能要求备注项目名称、地址等特定信息。此时若涉及第三方付款，需在备注中同时说明付款方与交易关系（如“委托XX公司支付本项目工程款”），以满足行业税务合规要求。

2. 从合同履行角度

• 合同约定优先：若委托人与收款方在合同中明确约定“发票开具给委托人，付款由第三方代付”，且未要求备注，则按合同执行即可。但为避免纠纷，建议将付款方式写入合同条款（如“乙方同意由XX公司代甲方支付本合同款项，发票直接开具给甲方”），并明确是否需备注。
• 无约定时的风险防范：若合同未约定付款方与发票方分离的情况，收款方可能因“发票开具对象与收款方不一致”拒绝开票。此时备注“委托付款”可辅助证明交易关系，减少收款方顾虑。

3. 从实务操作角度

• 备注内容建议：若需备注，可写明“委托XX公司（统一社会信用代码：XXX）付款”或“代付方：XX公司”，并保留委托付款协议、三方签字确认函等证明材料，以备税务稽查或审计时使用。
• 例外情形：若第三方付款为“债务转移”（即原债务人退出，第三方成为新债务人），则需重新签订合同并明确发票开具对象，此时备注“委托付款”可能不适用，需按新合同关系处理。

总结建议：为降低税务风险、避免合同纠纷，在委托第三方付款且发票开给委托人时，建议备注说明付款方与交易关系。若交易复杂或金额较大，可提前与税务机关、交易对方沟通确认备注要求，或咨询专业律师起草/审核相关协议。如有进一步疑问，可直接向我提问。