关于“代付款证明是否一定要三方盖章”的问题，这并非一个具有固定答案的规范性问题，而是取决于具体的业务场景、合同约定以及相关法律法规的要求。以下是我为您提供的详细解答：

一、业务场景与合同约定

1. 三方协议场景：

   • 在涉及三方（如建设单位、总承包单位、分包方）的代付款业务中，如果三方签订了代付款协议，并且协议中明确规定了代付款的流程、责任和义务，那么通常这份协议需要三方共同盖章确认，以确保协议的法律效力和执行力。
   • 三方盖章的协议能够明确各方的权利和义务，减少纠纷和风险，特别是在涉及资金流转和税务合规的方面。

2. 非三方协议场景：

   • 如果代付款业务仅涉及两方（如付款方和收款方），并且双方已经通过其他方式（如书面合同、电子邮件确认等）明确了代付款的意向和条件，那么可能不需要第三方盖章。
   • 在这种情况下，代付款证明的形式可能更加灵活，但同样需要确保具有足够的法律效力和可追溯性。

二、相关法律法规要求

1. 发票管理办法：

   • 根据《中华人民共和国发票管理办法》的规定，销售商品、提供服务以及从事其他经营活动的单位和个人，对外发生经营业务收取款项时，收款方应当向付款方开具发票。
   • 在代付款业务中，如果涉及发票的开具和接收，需要确保符合发票管理办法的规定，包括发票的开具方、接收方、金额等信息的一致性。

2. 税务合规性：

   • 代付款业务需要确保税务合规性，避免违反税收法律法规的规定。
   • 如果代付款业务涉及税务申报、缴纳等环节，需要确保相关税务处理的准确性和及时性。

三、建议与注意事项

1. 明确协议内容：

   • 无论是否涉及三方盖章，都应确保代付款协议的内容明确、具体，包括代付款的金额、时间、方式、责任和义务等。

2. 保留相关证据：

   • 在代付款业务中，应保留好相关的证据材料，如协议、发票、转账记录等，以备不时之需。

3. 咨询专业人士：

   • 如果对代付款业务的法律效力和税务合规性存在疑问，建议咨询专业的法律人士或税务顾问，以确保业务的合法性和合规性。

四、针对您提供的参考信息

• 在您提供的纳税咨询案例中，涉及三方代收代付协议的情况，通常需要三方共同盖章确认协议的法律效力。
• 银税三方（委托）划缴协议则是一种特定的税务缴纳协议，涉及纳税人、税务机关和开户银行三方，同样需要三方共同签署和盖章。

综上所述，代付款证明是否需要三方盖章取决于具体的业务场景、合同约定以及相关法律法规的要求。在涉及多方参与和复杂资金流转的代付款业务中，建议采用三方盖章的方式以确保协议的法律效力和执行力。