结论前置：在职员工工资发不出来的情况下，保密协议本身的有效性并不直接受影响，但用人单位以此为由不发工资的行为是不合法的。以下从多个角度进行分析：
一、工资支付的法定性
根据我国《劳动法》第五十条的规定，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。这意味着，只要劳动者按照劳动合同的约定提供了正常劳动，用人单位就有义务按时足额支付工资，这是用人单位的法定义务，不受其他任何条件（如签订保密协议）的制约。因此，即使员工未签订保密协议，用人单位也不能以此为由不发工资。
二、保密协议与工资支付的关系
保密协议与工资支付是两个不同的法律关系，不能将二者强制捆绑。保密协议是为了保护公司的商业秘密而与员工签订的一种协议，它并不能成为不发工资的借口或前提。如果用人单位以不发工资这种胁迫手段迫使劳动者签订保密协议，该保密协议可能因违反劳动者的真实意愿而被认定为无效或可撤销。因此，保密协议的有效性并不取决于工资是否发放，而是取决于协议本身的合法性和双方的真实意愿。
三、用人单位拒绝支付工资的法律后果
若用人单位以未签订保密协议为由不发工资，劳动者可以采取以下措施维护自己的合法权益：
友好协商：首先尝试与公司进行协商，明确表达立场和诉求，即工资应当按时足额支付，与是否签订保密协议无关。
保留证据：在处理这类问题时，建议保留好所有相关的证据，如劳动合同、工资条、银行转账记录等，以便在需要时证明自己的权益。
法律途径：如果公司坚持要求先签保密协议再发工资，劳动者可以向当地的劳动监察部门投诉，或者申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。根据《劳动保障监察条例》第二十六条的规定，用人单位克扣或者无故拖欠劳动者工资报酬的，由劳动保障行政部门责令限期支付劳动者的工资报酬，并可能加付赔偿金。
四、对劳动者的建议
了解法律：劳动者应当了解自己的权益和义务，明确工资支付的法定性和保密协议的独立性。
积极维权：如果遇到用人单位以未签订保密协议为由不发工资的情况，劳动者应当积极运用法律武器来维护自己的权益。
咨询专业：在处理这类问题时，如果劳动者对法律程序或证据收集等方面存在疑问，可以直接向我咨询，我会提供专业的法律建议和帮助。
综上所述，在职员工工资发不出来的情况下，保密协议本身的有效性并不直接受影响。但用人单位以此为由不发工资的行为是不合法的，劳动者应当积极维护自己的合法权益。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。