事业单位员工病假跨年累计3个月，是否需要扣工资，这主要取决于具体的单位规定以及相关的法律法规。以下是从不同角度对此问题的详细分析：
单位内部规定：
- 事业单位通常会有自己的内部规章制度，这些制度会详细规定员工病假期间的工资待遇。因此，首先需要查阅所在事业单位的相关规定，了解病假期间工资的具体发放标准。
- 如果单位规定病假期间工资全额发放，那么即使病假跨年累计3个月，也不需要扣工资。
- 如果单位规定病假期间工资按照一定比例发放或者有其他限制条件，那么就需要按照这些规定来执行。
国家法律法规：
- 根据《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》（虽然此规定主要针对企业职工，但事业单位在制定内部规定时通常会参考类似原则），医疗期是指企业职工因患病或非因工负伤停止工作治病休息不得解除劳动合同的时限。医疗期的长度根据职工实际参加工作年限和在本单位工作年限来确定，一般为3个月到24个月不等。
- 在医疗期内，职工的工资待遇通常会有一定的保障，但具体标准可能因地区和单位而异。对于事业单位员工，如果病假在医疗期内，且单位没有额外规定扣减工资，那么一般不应扣减工资。
- 如果病假超过了医疗期，或者单位有额外规定（如病假超过一定天数后工资按比例发放），那么就需要按照这些规定来执行。
实际操作建议：
- 查阅单位规定：首先，建议查阅所在事业单位的规章制度，了解病假期间工资的具体发放标准。
- 咨询人事部门：如果对单位规定有疑问或不清楚，可以咨询单位的人事部门或相关负责人，以获取更准确的信息。
- 了解法律法规：同时，也可以了解国家关于病假工资的相关法律法规，以便在必要时维护自己的合法权益。
总结来说，事业单位员工病假跨年累计3个月是否需要扣工资，并没有一个统一的答案。它取决于单位的具体规定以及相关的法律法规。因此，建议首先查阅单位规定，并咨询人事部门或相关负责人以获取准确信息。如果对单位规定或法律法规有疑问或不清楚，也可以进一步向我咨询，我会根据您的具体情况提供更详细的法律建议。