政府部门职能划转后签订的合同，原则上继续有效，但需根据职能划转的具体情况，分情形处理后续履行、变更或终止事宜。以下从不同角度展开分析：

1. 合同继续履行的情况
   若职能划转仅涉及政府部门内部职能调整（如同一部门内部分工变化，或不同部门间职能转移但合同性质未变），且合同相对方（如企业、个人）未受实质影响，则合同应继续履行。例如，原由A部门签订的环保监管合同，因职能调整划转至B部门，但合同内容、权利义务未变，此时B部门应承接原合同权利义务，继续履行。

2. 合同变更或补充协议的情况
   若职能划转导致合同主体、内容或履行方式发生实质性变化（如原由A部门签订的政府采购合同，因职能划转需由B部门作为新主体履行），则需双方协商签订补充协议，明确变更后的权利义务。例如，原合同中约定的验收标准、付款方式等因职能划转需调整的，应通过补充协议固定，避免后续纠纷。

3. 合同终止或解除的情况
   若职能划转导致合同目的无法实现（如原合同基于特定政策或职能签订，划转后该政策或职能已取消），或合同相对方明确表示反对继续履行，则可依据《民法典》第五百六十三条（法定解除权）或双方约定解除合同。例如，原由A部门签订的特定行业补贴合同，因职能划转后该行业监管权移交，且新政策不再支持补贴，此时可协商终止合同。

4. 特殊情形：政府与社会资本合作（PPP）合同
   若涉及PPP项目合同，职能划转可能触发《政府和社会资本合作项目财政管理暂行办法》等特殊规定。此时需重点审查合同中关于“政府方主体变更”的条款，若未明确约定，则需按“权责对等”原则，由承接职能的新部门继续履行合同，并确保财政资金安排、绩效评价等配套机制同步衔接。

建议行动步骤：

1. 核查职能划转的官方文件（如“三定方案”、部门职责调整通知），明确划转范围及对合同的影响；
   
2. 与合同相对方沟通，评估继续履行、变更或终止的可行性；
   
3. 必要时委托律师起草补充协议或终止协议，确保程序合法、内容完备；
   
4. 关注职能划转后的财政资金、人员交接等配套措施，避免因衔接不畅导致违约。
   

如有具体合同或职能划转文件，可进一步向我提供细节，我会结合实际情况为您分析。