针对您提出的“政府单位合同纠纷怎么处理”的问题，以下是我为您提供的详细解答：
政府单位在面临合同纠纷时，应遵循一系列有序且合法的处理程序。这些程序旨在确保纠纷得到公正、高效的解决，同时维护政府单位的合法权益。以下是具体的处理步骤和建议：
一、初步协商与调解
和解：
- 当合同发生纠纷时，首先建议双方进行友好协商，尝试在尊重双方利益的基础上就争议事项达成一致。
- 和解是成本最低、效率最高的解决方式，有助于维护双方长期的合作关系。
行政调解：
- 如果协商未能达成一致，可以考虑寻求行政调解。这通常涉及工商行政管理机关或其他相关政府部门居中调解。
- 调解过程中，应充分表达自身诉求，同时倾听对方意见，寻求双方都能接受的解决方案。
二、正式仲裁与诉讼
仲裁：
- 如果协商和调解均未能解决纠纷，且合同中包含了仲裁条款或双方事后达成了仲裁协议，则可以将纠纷提交给法定的仲裁机构进行裁决。
- 仲裁具有专业性、保密性和高效性，是解决合同纠纷的一种重要方式。
诉讼：
- 当没有仲裁协议或仲裁不是双方选择的解决方式时，任何一方均可向人民法院提起民事诉讼。
- 诉讼过程中，需要全面收集证据，按照诉讼规则进行应诉，以确保自身权益得到维护。
三、特别注意事项
- 及时报告：政府单位在面临合同纠纷时，应及时向上级部门或相关领导报告，以便获得指导和支持。
- 全面收集证据：无论采取何种解决方式，全面、准确地收集证据都是至关重要的。这有助于证明自身主张，提高胜诉率。
- 遵守法律法规：在处理合同纠纷过程中，应严格遵守相关法律法规和程序规定，确保处理过程的合法性和正当性。
四、法律依据
- 根据《政府合同管理规定》第二十三条，政府合同履行过程中发生纠纷时，合同承办单位应当首先采取协商、调解方式解决。经协商或者调解达成一致意见的，应当签订书面协议。不能达成一致意见的，应当及时报市人民政府由市司法行政部门代表市人民政府提起诉讼或者仲裁解决。
- 同时，《民法典》第十条也规定了处理民事纠纷应依照法律进行。
综上所述，政府单位在处理合同纠纷时应遵循协商、调解、仲裁、诉讼等有序的处理程序，并注重证据的收集和法律法规的遵守。希望这些建议能对您有所帮助。