关于如何将村干部（这里主要指村委会）出租出去的土地协议变得合法，这是一个涉及多个法律层面的复杂问题。以下是我为您提供的详细解答：
一、合法性的核心要素
要使村委会出租土地的协议合法，必须满足以下几个核心要素：
法定程序：
- 根据《中华人民共和国村民委员会组织法》及相关土地管理法规，村委会在出租土地前，必须召开村民会议或村民代表会议，并获得三分之二以上成员或代表的同意。这是确保出租行为在程序上合法的关键步骤。
村民意愿：
- 出租土地涉及村民的切身利益，因此必须尊重村民的意愿。特别是当出租的土地属于村集体的机动地或村民承包的地时，还需征得相关村民或承包人的明确同意。
土地用途管制：
- 我国实行严格的土地用途管制制度。村委会出租的土地必须符合土地利用总体规划和相关法律法规的规定。农用地不得擅自转为非农业建设用地，否则将构成违法。
合同内容合法：
- 租赁合同必须是双方真实意思的表示，且合同内容不得违反法律法规的强制性规定。这包括租金、租期、土地用途、双方权利义务等条款的明确与合理。
二、确保合法性的具体步骤
为了确保村委会出租土地的协议合法，可以遵循以下具体步骤：
召开会议并征求意见：
- 村委会应组织召开村民会议或村民代表会议，就出租土地的事宜进行充分讨论，并征求村民的意见。确保出租行为得到三分之二以上成员或代表的同意。
明确土地用途和规划：
- 在出租前，村委会应明确土地的用途和规划，确保承租方的使用符合土地利用总体规划和相关法律法规的规定。如土地为集体建设用地，承租方的使用应符合规划用途。
公开招标与合同签订：
- 村委会出租土地时，应遵循公开、公平、公正的原则，通常需要进行公开招标。在选定承租方后，双方应签订详细的租赁合同，明确租赁期限、租金标准、土地用途、双方权利义务等内容。
法律审查与备案：
- 在签订合同前，建议村委会咨询专业法律人士，对合同内容进行法律审查，确保合同的合法性和有效性。同时，根据当地规定，可能还需要将合同进行备案或登记。
三、不合法情形的防范
为了避免出租行为的不合法性，村委会应注意防范以下情形：
未经法定程序擅自出租：
- 村委会不得未经村民会议或村民代表会议讨论决定，擅自决定将土地出租。否则，将构成程序违法，村民有权拒绝并可通过法律途径维护权益。
改变土地用途：
- 村委会应严格监督承租方的使用行为，确保土地用途符合规划用途。如承租方擅自改变土地用途，村委会应及时制止并报告相关部门。
合同内容违法：
- 村委会应确保租赁合同的内容合法合规，不得包含违反国家强制性规定的条款。如租金不合理、租期过长或违法的土地用途等。
四、总结与建议
综上所述，要使村委会出租土地的协议合法，必须严格遵守法定程序、尊重村民意愿、确保土地用途合法且符合国家规划和政策要求。在签订合同前，建议村委会咨询专业法律人士以获取法律意见，并密切关注土地利用规划和相关法律法规的变化。在发生争议时，应及时寻求法律援助，通过法律途径解决纠纷。