公交公司扣职工事故责任款，通常需基于合法合规的规章制度，且需满足一定条件与程序，常见依据包括劳动合同约定、公司规章制度规定以及法律法规要求。以下从这几个方面详细阐述：

1. 劳动合同约定
   公交公司与职工签订的劳动合同中，往往会明确约定职工在发生事故时的责任承担方式及赔偿标准。若合同中有相关条款，且该条款不违反法律法规的强制性规定，公交公司可依据合同约定扣除职工的事故责任款。但需注意，合同条款应公平合理，不得显失公平或加重职工责任，否则可能因条款无效而无法执行。

2. 公司规章制度规定
   公交公司通常会制定内部规章制度，对职工的工作行为、事故处理及责任承担等进行规范。若规章制度中明确规定了事故责任款的扣除标准、程序及条件，且该制度已依法向职工公示或告知，公交公司可依据制度规定扣除职工的事故责任款。但同样需确保制度内容合法合规，不侵犯职工合法权益。

3. 法律法规要求
   在特定情况下，法律法规可能直接规定职工在事故中的责任承担方式。例如，若职工因故意或重大过失导致事故发生，且给公交公司造成损失的，根据《中华人民共和国劳动合同法》等相关法律法规，公交公司有权要求职工承担赔偿责任。但扣除的款项不得超过职工当月工资的20%，且扣除后剩余工资不得低于当地最低工资标准。若事故责任涉及第三方赔偿或保险理赔，公交公司还需根据具体情况与职工协商处理。

额外提醒：
公交公司在扣除职工事故责任款时，应确保程序合法合规，包括事先告知职工扣除依据、金额及计算方式，听取职工陈述申辩，并保留相关证据材料。若职工对扣除决定有异议，可通过内部申诉、劳动争议调解仲裁或诉讼等途径维护自身权益。

建议：
若您作为公交公司职工，对事故责任款的扣除存在疑问或争议，建议首先查阅劳动合同及公司规章制度，了解扣除依据及标准。若认为扣除决定不合理或违法，可及时向公司提出异议，并寻求法律帮助以维护自身权益。如有具体法律问题，欢迎直接向我咨询。