破产重整企业中工会经费的处理需依据《企业破产法》《工会法》及相关司法解释，结合企业重整方案、工会财产独立性及职工权益保护原则综合判断，核心结论如下：

1. 工会经费的独立性原则
   根据《工会法》第四十四条，工会经费属于工会独立财产，企业破产时工会经费不纳入破产财产范围。若工会设立独立账户且经费来源清晰（如职工工资扣缴、企业拨缴、工会资产收益等），重整程序中应优先保障工会经费的独立性，不得被管理人随意划转或冻结。
   例外情形：若工会经费与企业财产混同（如未独立建账、经费被企业挪用），管理人可依据《企业破产法》第三十三条追回混同财产，但需通过法律程序确认混同事实。

2. 重整计划中的工会经费安排
   重整计划需明确工会经费的处置方式：

   • 继续使用：若企业继续经营，工会经费可按《工会法》规定继续用于职工福利、文体活动等，但需在重整计划中列明预算及使用规则；
     
   • 部分清偿：若企业需削减债务，工会经费中属于企业拨缴部分（如按工资总额2%计提但未实际支付的部分）可能被纳入债务调整范围，但需与工会协商并保障职工基本权益；
     
   • 终止清算：若重整失败转入破产清算，工会经费中属于企业未拨缴部分可能被列为普通债权，按清偿顺序受偿，但已独立管理的经费仍优先用于职工安置。

3. 职工权益的特殊保护
   根据《企业破产法》第八条，重整计划草案需“妥善安排职工权益”。工会经费中涉及职工福利的部分（如困难职工补助、医疗互助金）应优先保障，管理人不得以“优化债务结构”为由擅自截留。若工会经费不足，可依据《工会法》第四十一条申请上级工会支持或通过职工代表大会协商补充方案。

4. 实务操作建议

   • 企业端：重整前应梳理工会经费账目，确保独立建账并留存拨缴凭证；重整计划中明确工会经费使用规则，避免后续纠纷；
     
   • 工会端：主动参与重整程序，通过职工代表大会或债权人会议监督经费使用，必要时可申请法院指定工会代表参与管理人工作；
     
   • 管理人端：处理工会经费时需区分“企业财产”与“工会财产”，避免因程序瑕疵引发行政处罚（如《工会法》第四十六条规定的“侵占工会经费”责任）。

若企业或工会对具体操作有疑问，可直接向我咨询，我将结合案例进一步分析。