离职证明的原件一般不由单位留存，而是由劳动者本人持有，但在特定情况下，如办理档案存档等，可能需要提交原件或经过认证的复印件。以下从不同角度为您详细分析：
一、离职证明的法律性质与用途
离职证明是用人单位在解除或终止劳动合同时，依法出具的证明劳动者与该单位劳动关系解除或终止的书面文件。它具有法律效力，是劳动者办理失业登记、领取失业金、社保关系转移、新工作入职等手续的重要依据。因此，离职证明的原件对于劳动者来说至关重要，应妥善保管。
二、离职证明的原件与复印件的提交要求
常规情况下：
- 在办理新工作入职手续时，新单位通常要求求职者提供离职证明以确认已解除或终止与前单位的劳动关系。此时，提供离职证明的复印件一般即可满足新单位的审核需求。但为了确保手续的顺利办理并避免后续可能出现的法律纠纷，建议劳动者尽量提交原件。
- 若新单位要求将离职证明作为员工档案的一部分进行存档备案，同样，提供复印件在多数情况下也是可行的，但原件的法律效力和证明力更高。
特殊情况下：
- 背景调查核实：若新单位对求职者的背景调查较为严格，可能会要求提供离职证明原件，以便直接与原单位核实相关信息的真实性。
- 特殊行业或岗位要求：如金融、财务、保密岗位等，由于工作性质的特殊性，对员工的背景审查更为严格。在这些情况下，用人单位可能会要求求职者提供离职证明原件。
- 办理重要事务：在办理社保转移、公积金提取等重要事务时，往往要求提供离职证明原件，因为原件具有更高的法律效力和证明力。
- 档案存档：虽然档案里的离职证明原则上应当是原件，但在某些特殊情况下，如原件丢失、损毁，或原单位无法重新出具原件，员工可提供相关的说明材料（如原单位的情况说明、曾提交原件的相关记录等），并经档案管理部门严格核实后，可能接受经过有效认证的复印件（如公证机关公证的复印件或由档案管理认可的权威第三方机构盖章确认的复印件）。
三、用人单位与劳动者的义务与责任
用人单位的义务：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》第五十条的规定，用人单位在解除或终止劳动合同时，必须出具离职证明原件，并在十五日内为劳动者办理档案和社会保险关系转移手续。这是用人单位的法定义务，违反者可能面临劳动行政部门的责令改正以及因给劳动者造成损害而承担的赔偿责任。
劳动者的责任：
- 劳动者应妥善保管好离职证明原件，并在需要时及时提交。若无法提供原件，则应尽可能提供加盖公章的复印件并确保其内容的真实性和准确性。同时，劳动者在离职时，有权向用人单位索取离职证明原件。
四、应对措施与建议
若用人单位拒绝提供离职证明原件：
- 劳动者可以首先尝试与公司进行沟通，明确表达需求并了解拒绝提供的原因。
- 若协商无果，劳动者可以向当地劳动行政部门投诉，要求其责令用人单位改正。
- 若问题仍未解决，劳动者可以向劳动仲裁委员会申请仲裁，要求用人单位依法出具离职证明原件，并主张因未及时提供造成的相关损失赔偿。
对于劳动者而言：
- 建议在离职时，务必向用人单位索取离职证明原件，并妥善保管。
- 在办理相关手续或证明自己的就业状态时，如需使用离职证明，应优先提供原件。若确实无法提供原件，则应提供经过有效认证的复印件，并附上相关说明材料。
综上所述，离职证明的原件一般不由单位留存，而是由劳动者本人持有。但在特定情况下，如办理档案存档等，可能需要提交原件或经过认证的复印件。劳动者应妥善保管好离职证明原件，并在需要时及时提交。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。