结论：小产权房与房主的儿子签订的合同，一般不能进行公证，且该合同可能因主体不适格或房屋性质问题而面临效力风险。以下从多个角度进行详细分析：

一、公证的角度

1. 公证的基本要求：

   • 公证是公证机构根据自然人、法人或者其他组织的申请，依照法定程序对民事法律行为、有法律意义的事实和文书的真实性、合法性予以证明的活动。
   • 公证要求申请公证的事项必须真实、合法，且申请人必须具有相应的民事行为能力。

2. 小产权房与房主儿子签订合同的公证问题：

   • 小产权房通常指的是在农村集体土地上建设的房屋，未缴纳土地出让金等费用，其产权证不是由国家房管部门颁发，而是由乡政府或村政府颁发，亦称“乡产权房”。
   • 由于小产权房的产权性质特殊，其买卖、转让等行为往往受到法律限制，甚至可能被认定为无效。
   • 因此，即使房主的儿子作为合同的一方，由于房屋本身的产权问题，该合同可能无法满足公证的真实性、合法性要求，从而无法进行公证。

二、合同效力的角度

1. 合同主体的适格性：

   • 合同双方应当具有相应的民事行为能力，且合同内容应当合法、真实。
   • 如果房主的儿子并非房屋的合法产权人，或者未经产权人授权擅自处分房屋，那么其签订的合同可能因主体不适格而无效。

2. 房屋性质对合同效力的影响：

   • 小产权房由于产权性质特殊，其买卖、转让等行为可能受到法律限制。
   • 根据相关法律法规，小产权房的买卖合同可能因违反法律强制性规定而被认定为无效。
   • 因此，即使房主的儿子作为合同的一方，由于房屋本身的小产权性质，该合同也可能面临效力风险。

三、法律建议

1. 谨慎签订合同：

   • 在签订涉及小产权房的合同时，应当谨慎审查合同主体的适格性、房屋的产权性质以及合同内容的合法性。
   • 避免与无权处分人或未经授权的人签订合同，以免陷入法律纠纷。

2. 咨询专业律师：

   • 在涉及小产权房的交易中，建议咨询专业律师以获取更详细的法律意见和风险评估。
   • 律师可以根据具体情况分析合同的效力、可能面临的法律风险以及应对策略。

3. 了解相关政策法规：

   • 密切关注当地关于小产权房的政策法规变化，以便及时调整交易策略和风险防范措施。

总结：小产权房与房主的儿子签订的合同，由于房屋产权性质的特殊性和合同主体可能的不适格性，一般不能进行公证，且该合同可能面临效力风险。在涉及此类交易时，建议谨慎签订合同并咨询专业律师以获取更详细的法律意见。如有任何法律问题，可以直接向我咨询，我将竭诚为你提供专业的法律服务。