申请执行人与案外人执行和解协议的管辖法院确定，需根据不同情况进行分析，具体如下：

1. 若执行和解协议涉及原生效法律文书确定的权利义务关系，且未改变原执行法院管辖的：

   • 此时，执行和解协议的管辖法院通常仍为原生效法律文书确定的执行法院。因为执行和解协议本质上是对原执行依据的履行方式的变更，并未改变原执行案件的管辖基础。例如，原判决由A法院作出并进入执行程序，申请执行人与案外人就判决内容的履行达成和解协议，那么该和解协议的管辖法院仍为A法院。

2. 若执行和解协议涉及新的权利义务关系，或对原执行法院管辖提出异议并达成新的管辖约定的：

   • 在这种情况下，如果执行和解协议中明确约定了新的管辖法院，且该约定不违反法律关于专属管辖和级别管辖的规定，那么应按照和解协议中的约定确定管辖法院。例如，申请执行人与案外人在和解协议中约定，因履行和解协议产生的争议由B法院管辖，且该约定合法有效，那么B法院即为管辖法院。
   • 如果执行和解协议未约定管辖法院，但涉及新的权利义务关系，且该关系与原执行案件无直接关联，那么可能需要根据《民事诉讼法》中关于一般地域管辖或特殊地域管辖的规定来确定管辖法院。例如，如果和解协议涉及的是案外人向申请执行人提供新的财产作为担保，且该担保财产位于C法院辖区，那么因担保财产引发的争议可能由C法院管辖（具体需根据担保财产的类型和法律规定判断）。

3. 若执行和解协议被认定为构成新的合同关系，且该合同关系与原执行案件完全独立：

   • 在这种情况下，执行和解协议应被视为一个新的合同，其管辖法院的确定应遵循合同纠纷的管辖原则。即，如果合同中有约定管辖法院，且约定合法有效，则按照约定确定；如果没有约定或约定不明确，则根据《民事诉讼法》中关于合同纠纷管辖的规定（如被告住所地、合同履行地等）来确定管辖法院。

总结与建议：

• 在签订执行和解协议时，建议明确约定管辖法院，以避免后续因管辖问题产生争议。
• 如果对管辖法院的确定存在疑问或争议，建议及时咨询专业律师，以便根据具体情况进行准确判断和应对。
• 在处理执行和解协议相关纠纷时，应充分了解并遵循相关法律法规和司法解释的规定，以确保自身权益得到有效维护。