针对农村土地上有建筑但无法确权的问题，核心结论是需根据具体原因采取针对性措施，包括补办手续、解决纠纷、确认合法性或寻求法律救济等。以下从不同角度详细分析：
一、建筑未取得合法建设手续导致无法确权
若建筑未取得乡村建设规划许可证、宅基地使用权证等必要手续，可能因违法建设而无法确权。
补办手续：
- 步骤：首先需确认建筑是否符合当地土地利用总体规划和村庄规划。若符合，可向当地乡镇政府或自然资源部门申请补办相关手续，如乡村建设规划许可证、宅基地使用权证等。
- 法律依据：根据《城乡规划法》第六十五条，在乡、村庄规划区内未依法取得乡村建设规划许可证或者未按照乡村建设规划许可证的规定进行建设的，由乡、镇人民政府责令停止建设、限期改正；逾期不改正的，可以拆除。但若建筑符合规划且可补办手续，则有机会通过补办完成确权。
拆除或整改：
- 情况：若建筑不符合规划或无法补办手续，可能面临拆除或整改要求。
- 建议：在此情况下，应积极与相关部门沟通，了解具体整改要求，并尽快采取行动以减少损失。若认为拆除或整改决定不合理，可寻求法律救济。
二、土地权属存在争议导致无法确权
若土地权属存在争议，如与邻居或村集体之间存在土地边界、使用权等争议，将影响确权进程。
协商解决：
- 步骤：首先尝试与争议方进行协商，通过友好沟通达成一致意见，明确土地权属和建筑归属。
- 建议：在协商过程中，可邀请村干部或第三方调解机构参与，以增加协商的成功率。
行政调解或仲裁：
- 步骤：若协商无果，可向当地乡镇政府或自然资源部门申请行政调解或仲裁。
- 法律依据：根据《土地管理法》第十四条，土地所有权和使用权争议，由当事人协商解决；协商不成的，由人民政府处理。单位之间的争议，由县级以上人民政府处理；个人之间、个人与单位之间的争议，由乡级人民政府或者县级以上人民政府处理。
法律诉讼：
- 情况：若行政调解或仲裁无法解决问题，可向人民法院提起诉讼。
- 建议：在诉讼过程中，应提供充分的证据证明自己的土地权属和建筑归属，如宅基地使用证、建房审批手续、证人证言等。
三、建筑属于违法建筑导致无法确权
若建筑属于违法建筑，如未经批准擅自占用土地建房、超面积建房等，将无法确权。
确认违法性质：
- 步骤：首先需确认建筑的违法性质，如是否属于未经批准擅自占用土地建房、超面积建房等。
- 建议：可咨询当地自然资源部门或乡镇政府，了解建筑的具体违法情况和可能的处理方式。
接受处罚并整改：
- 步骤：若建筑确实违法，需接受相关部门的处罚，并按照要求进行整改。
- 法律依据：根据《土地管理法》第七十七条，未经批准或者采取欺骗手段骗取批准，非法占用土地的，由县级以上人民政府自然资源主管部门责令退还非法占用的土地，对违反土地利用总体规划擅自将农用地改为建设用地的，限期拆除在非法占用的土地上新建的建筑物和其他设施，恢复土地原状；对符合土地利用总体规划的，没收在非法占用的土地上新建的建筑物和其他设施，可以并处罚款。
寻求法律救济：
- 情况：若认为处罚决定不合理或整改要求过高，可寻求法律救济。
- 建议：可咨询专业律师，了解自己的法律权益和可能的救济途径，如申请行政复议或提起行政诉讼等。
四、其他特殊情况导致无法确权
除上述情况外，还可能存在其他特殊情况导致无法确权，如建筑位于规划区内但尚未实施规划、建筑属于历史遗留问题等。
了解具体政策：
- 步骤：首先需了解当地的具体政策和规定，如规划区的实施时间、历史遗留问题的处理方式等。
- 建议：可咨询当地自然资源部门或乡镇政府，获取最准确的信息。
等待政策落实或申请特殊处理：
- 步骤：若建筑位于规划区内但尚未实施规划，可等待政策落实后再进行确权；若建筑属于历史遗留问题，可申请特殊处理或享受相关优惠政策。
- 法律依据：根据当地政策和规定，可能存在针对特定情况的特殊处理方式或优惠政策。
寻求专业帮助：
- 情况：若对政策理解不清或处理过程中遇到困难，可寻求专业帮助。
- 建议：可咨询专业律师或相关机构，获取更具体的指导和建议。
针对您的情况，我建议您首先确认建筑无法确权的具体原因，然后根据上述分析采取针对性措施。若您在处理过程中遇到任何困难或疑问，可直接向我咨询，我将根据您的具体情况提供更详细的法律建议。