核心结论：一车两人或多人运输卷烟超过100条，可能涉及行政处罚或刑事处罚，具体需根据运输主体、运输目的、是否取得相关许可等因素综合判断。以下分情况详细说明：

1. 无烟草专卖品准运证运输

   • 行政处罚：根据《中华人民共和国烟草专卖法》第二十一条及《中华人民共和国烟草专卖法实施条例》第五十二条，无烟草专卖品准运证运输烟草专卖品（包括卷烟），超过一定数量（如100条）的，由烟草专卖行政主管部门处以罚款，可以按照国家规定的价格收购违法运输的烟草专卖品；情节严重的，没收违法运输的烟草专卖品和违法所得。具体罚款数额根据运输卷烟的价值、数量等因素确定，一般按照运输卷烟价值的20%以上50%以下进行罚款。
   • 刑事处罚风险：若运输卷烟数量巨大（如达到刑事立案标准，具体标准因地区而异，但通常远高于100条），且存在逃避监管、多次运输等情节，可能构成非法经营罪。根据《中华人民共和国刑法》第二百二十五条，非法经营罪情节严重的，处五年以下有期徒刑或者拘役，并处或者单处违法所得一倍以上五倍以下罚金；情节特别严重的，处五年以上有期徒刑，并处违法所得一倍以上五倍以下罚金或者没收财产。

2. 有烟草专卖品准运证但超量运输

   • 行政处罚：即使持有烟草专卖品准运证，若运输的卷烟数量超过准运证规定的数量，同样可能面临烟草专卖行政主管部门的处罚，包括罚款、没收超量部分卷烟等。处罚力度会根据超量运输的具体情况（如超量比例、是否主动配合调查等）进行裁量。
   • 刑事处罚风险：单纯超量运输，若未达到刑事立案标准，一般不构成犯罪。但若超量运输行为伴随其他严重情节（如伪造、变造准运证，或者与无证运输者勾结等），则可能构成更严重的犯罪。

3. 特殊主体运输（如烟草公司员工）

   • 内部纪律处分：若运输者为烟草公司员工，且运输行为属于职务行为，但违反了公司内部关于卷烟运输的规定（如超量运输），则可能面临公司内部的纪律处分，如警告、罚款、降职、解雇等。
   • 法律责任：若运输行为同时违反了国家法律法规（如无证运输或超量运输），则除可能面临公司内部处分外，还需承担相应的法律责任。

建议：运输卷烟时，务必确保取得合法的烟草专卖品准运证，并严格按照准运证规定的数量、路线、时间等要求进行运输。若对运输卷烟的相关法律法规或程序有疑问，建议直接向我咨询，以便获得更具体、更准确的法律指导。