针对您提出的“无证运输50条卷烟怎么处罚”的问题，以下是我根据相关法律法规为您提供的详细解答：

一、法律责任判定

根据《中华人民共和国烟草专卖法》及相关法规，无证运输卷烟属于违法行为。具体来说，若未持有烟草专卖行政主管部门或其授权机构签发的准运证，而运输50条以上卷烟，将构成无证运输烟草专卖品的违法行为。

二、行政处罚措施

1. 罚款：烟草专卖行政主管部门将对无证运输卷烟的行为处以罚款。罚款金额通常根据违法运输的卷烟价值的一定比例来确定，具体比例可能因地区和案件情况而有所不同，但一般会在违法运输烟草专卖品价值的10%至20%之间，也有说法为20%至50%，实际处罚时会根据具体情况判定。

2. 没收：除了罚款外，烟草专卖行政主管部门还有权没收违法运输的卷烟以及违法所得。这意味着，您不仅可能面临经济损失，还可能失去运输的卷烟。

3. 取消经营资格：对于情节严重的无证运输行为，烟草专卖行政主管部门还可能取消相关经营者的经营资格，进一步限制其从事烟草相关业务的能力。

三、刑事责任风险

若无证运输卷烟的行为情节严重，还可能触犯《中华人民共和国刑法》中的非法经营罪。具体来说，以下情形可能构成非法经营罪的立案追诉标准：

• 非法经营数额达5万元以上；
• 违法所得数额达2万元以上；
• 曾因同类行为受过两次行政处罚后再次实施。

一旦构成非法经营罪，将面临五年以下有期徒刑或拘役，并处罚金的刑罚。情节特别严重者，还可能面临五年以上有期徒刑，并处罚金或没收财产。

四、特殊情形与注意事项

1. 邮寄限制：如果您是通过邮寄方式运输卷烟，需注意每次限寄两条（400支）。超量邮寄将按无证运输处理，同样可能面临罚款和没收等处罚。

2. 免税店商品：若您从免税店购买卷烟并携带入境，需凭有效凭证随身携带，并确保不超过免税额度。超出免税额度部分需申报纳税，否则也可能构成违法行为。

五、建议与提醒

为了避免不必要的法律风险和经济损失，我建议您在运输卷烟前务必咨询当地烟草专卖行政主管部门或相关法律人士，了解并遵守相关法律法规和携带限量规定。确保持有有效的烟草专卖品准运证，并严格按照准运证规定的数量进行运输。

综上所述，无证运输50条卷烟将面临严格的法律责任和处罚措施。为了您的合法权益和避免不必要的麻烦，请务必遵守相关法律法规和规定。