结论：执业药师和原药店签订的合同在原药店加入连锁店后是否还有效，这主要取决于合同的具体内容、双方当事人的意愿以及相关法律法规的规定。以下是从不同角度对此问题的详细分析：

1. 合同内容角度：

   • 合同条款的明确性：如果原合同中明确规定了药店经营模式变更（如加入连锁店）对合同效力的影响，那么应直接按照合同条款执行。例如，合同可能规定，在药店加入连锁店后，原合同自动终止或需经双方协商一致后修改。
   • 合同目的与履行：若合同目的与药店的经营模式紧密相关，且加入连锁店后原合同的履行方式、条件等发生根本性变化，导致合同目的无法实现，那么合同可能因无法履行而终止或需重新协商。

2. 双方当事人意愿角度：

   • 协商一致原则：根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，合同双方当事人可以协商一致变更或解除合同。因此，在原药店加入连锁店后，执业药师与药店（或连锁店）可以就原合同的继续履行、变更或解除进行协商，并达成一致意见。
   • 单方意愿的限制：若一方未经对方同意，擅自变更或解除合同，可能构成违约行为，需承担相应的法律责任。

3. 法律法规角度：

   • 合同法的适用：在原药店加入连锁店的过程中，若涉及合同的变更、解除或终止，应适用《中华人民共和国民法典》中关于合同的相关规定。特别是关于合同变更、解除的条件和程序，以及违约责任的规定。
   • 行业特殊性：考虑到执业药师与药店之间的合同可能涉及药品经营、执业资格等特殊事项，还需关注相关行业法规（如《药品经营质量管理规范》等）对合同效力的影响。

法律建议：

• 审查合同条款：执业药师应首先审查原合同中关于药店经营模式变更的条款，了解合同在药店加入连锁店后的具体效力。
• 与药店协商：在了解合同条款后，执业药师应与药店（或连锁店）进行协商，就原合同的继续履行、变更或解除达成一致意见。
• 寻求法律帮助：若双方无法就合同问题达成一致意见，执业药师可以寻求专业律师的帮助，通过法律途径解决纠纷。

可能的法律后果：

• 若合同继续有效，双方应继续履行合同义务，否则可能构成违约行为，需承担违约责任。
• 若合同因药店加入连锁店而变更或解除，双方应按照协商一致的结果或法律规定处理合同终止后的相关事宜，如结算、赔偿等。

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