跨单位合作并非必须在合同中约定知识产权权属，但强烈建议进行约定，以避免潜在的法律纠纷。以下从不同角度对此问题进行分析：

法律层面

1. 法定原则与约定优先：

   • 根据《中华人民共和国民法典》及相关知识产权法律法规，知识产权的归属通常遵循“有约定从约定，无约定从法定”的原则。这意味着，如果合作双方在合同中明确约定了知识产权的权属，那么该约定将具有法律效力，双方应依约履行。
   • 若合同中未约定知识产权权属，则可能依据相关法律法规的默认规则来确定归属，这往往可能引发争议，因为不同法律对于不同类型的知识产权（如专利、商标、著作权等）的归属可能有不同的规定。

2. 避免法律纠纷：

   • 在跨单位合作中，由于涉及多方利益和复杂的业务关系，知识产权的归属问题往往成为争议的焦点。通过合同明确约定知识产权权属，可以大大降低法律纠纷的风险，保护各方的合法权益。

实践层面

1. 促进合作顺利进行：

   • 明确的知识产权权属约定有助于合作双方在合作过程中明确各自的权利和义务，避免因为权属不清而导致的合作障碍或冲突。这有助于促进合作的顺利进行，提高合作效率。

2. 保护创新成果：

   • 知识产权是创新成果的重要体现。通过合同约定知识产权权属，可以确保创新成果得到合理的保护和利用，激励合作双方进行更多的创新活动。

3. 应对潜在风险：

   • 在跨单位合作中，可能存在一方利用合作机会窃取或不当使用另一方知识产权的风险。通过合同明确约定知识产权权属，可以为合作双方提供法律保障，应对潜在的风险。

建议与操作

1. 详细约定：

   • 在合作合同中，应详细约定知识产权的权属、使用范围、许可方式、收益分配等关键条款。这有助于确保合作双方的权益得到充分保障。

2. 法律审查：

   • 在签订合作合同前，建议双方聘请专业律师对合同进行法律审查，确保合同条款的合法性和有效性。这有助于避免因为合同条款不当而导致的法律纠纷。

3. 及时沟通与协商：

   • 在合作过程中，如果双方对知识产权权属等问题存在争议或疑问，应及时进行沟通与协商，寻求妥善解决方案。这有助于维护合作关系的稳定和持续发展。

总结来说，虽然跨单位合作并非必须在合同中约定知识产权权属，但考虑到法律纠纷的风险、合作顺利进行的需要以及创新成果的保护等因素，强烈建议合作双方在合同中明确约定知识产权权属。如有任何疑问或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。