根据《安全生产法》及相关法规，铁路工程发生死亡5人的事故，属于较大事故等级，需依法承担行政责任、民事赔偿责任，情节严重的还可能涉及刑事责任。具体处理方式如下：

1. 行政责任层面
   根据《安全生产法》第一百一十四条，发生较大事故的，对负有责任的生产经营单位（如铁路工程建设单位、施工单位等）处100万元以上200万元以下的罚款；对主要负责人、直接负责的主管人员和其他直接责任人员，处上一年年收入40%以上60%以下的罚款。
   此外，应急管理部门会责令限期改正、停产停业整顿，并可能吊销相关资质证书（如安全生产许可证）。若事故涉及违法分包、转包等行为，还会依据《建筑法》《招标投标法》等进一步处罚。

2. 民事赔偿责任层面
   根据《民法典》侵权责任编，施工单位需对死者家属承担民事赔偿责任，包括丧葬费、死亡赔偿金、被扶养人生活费、精神损害抚慰金等。赔偿标准按受诉法院所在地上一年度城镇居民人均可支配收入或农村居民人均纯收入的20倍计算（具体以当地司法实践为准）。若施工单位购买了安全生产责任保险或工伤保险，保险公司需在保额范围内先行赔付，不足部分由施工单位补足。

3. 刑事责任层面
   若事故调查认定存在“强令、组织他人违章冒险作业”或“明知存在重大事故隐患而不排除，仍冒险组织作业”等情形，直接负责的主管人员和其他直接责任人员可能涉嫌《刑法》第一百三十四条的“强令、组织他人违章冒险作业罪”，最高可处五年以下有期徒刑；情节特别恶劣的，处五年以上有期徒刑。
   若事故因施工单位违反安全管理规定导致（如未设置安全防护设施、未进行安全培训等），可能涉嫌“重大责任事故罪”，对直接责任人员处三年以下有期徒刑或者拘役；情节特别恶劣的，处三年以上七年以下有期徒刑。

补充说明：
事故处理流程通常包括：

• 立即启动应急预案，抢救人员、保护现场；
  
• 1小时内向当地应急管理部门、铁路监管部门报告；
  
• 配合政府调查组查明事故原因（如技术原因、管理原因等）；
  
• 根据调查报告落实整改措施，防止类似事故再次发生。
  

若您是涉事方或家属，建议尽快固定证据（如合同、安全记录、监控视频等），并依据事故调查报告明确责任主体。如有进一步疑问，可直接向我咨询具体法律问题。