银行发现抵押物被二次抵押时，应首先根据抵押合同约定、法律规定及实际情况，采取以下措施进行处理：

1. 核查抵押合同条款

   • 银行应立即核查与抵押人签订的抵押合同中，是否明确约定了禁止抵押物二次抵押的条款。若合同中有此约定，且抵押人未经银行同意擅自进行二次抵押，则抵押人已构成违约。
   • 根据合同约定，银行有权要求抵押人立即停止二次抵押行为，并可能要求抵押人承担违约责任，包括但不限于支付违约金、赔偿损失等。

2. 评估二次抵押的法律效力

   • 银行需评估二次抵押是否依法办理了抵押登记。根据《民法典》相关规定，抵押权自登记时设立。若二次抵押未办理登记，则该抵押权不得对抗善意第三人，银行作为第一顺位抵押权人的权益可能不受影响。
   • 若二次抵押已办理登记，银行需进一步分析两次抵押的债权范围、抵押物价值及清偿顺序等问题，以确定自身权益是否受到实质性损害。

3. 与抵押人协商解决方案

   • 在发现二次抵押后，银行应尽快与抵押人进行沟通，了解其二次抵押的原因及目的，并尝试通过协商达成解决方案。
   • 解决方案可能包括要求抵押人提前清偿部分或全部债务、增加担保措施（如提供其他抵押物或保证人）、调整贷款条件等，以降低银行的风险敞口。

4. 采取法律措施保护权益

   • 若协商无果或抵押人拒绝配合，银行有权根据合同约定及法律规定，采取法律措施保护自身权益。
   • 法律措施可能包括向法院提起诉讼，要求确认二次抵押无效、要求抵押人承担违约责任、申请财产保全以防止抵押物被进一步处置等。
   • 在诉讼过程中，银行需充分准备证据，包括抵押合同、抵押登记证明、二次抵押的相关证据等，以支持其诉讼请求。

5. 关注抵押物处置风险

   • 在处理二次抵押问题的过程中，银行需密切关注抵押物的处置风险。若抵押物因二次抵押而被其他债权人申请查封、扣押或拍卖等，银行应及时采取措施维护自身权益。
   • 银行可考虑与抵押人及其他债权人协商，共同制定抵押物处置方案，以确保银行作为第一顺位抵押权人的优先受偿权得到保障。