结论前置：在签订合同时，甲乙双方各持一份合同，其中一份盖公章、一份盖合同章，这种做法在法律上通常是可行的，但具体还需根据合同内容、双方约定以及相关法律法规来综合判断。

1. 公章与合同章的法律效力

• 公章：公章是法人权利的象征，在签订合同等法律文件时，加盖公章通常代表法人对合同内容的确认和接受，具有极高的法律效力。
• 合同章：合同章是专门用于签订合同的印章，其法律效力在合同签订范围内与公章相当。在合同上加盖合同章，同样表示双方对合同内容的认可和接受。

2. 合同份数与盖章方式

• 合同份数：合同份数通常根据双方需要和交易习惯来确定，可以是两份、多份甚至更多。每份合同在法律上应具有同等效力。
• 盖章方式：在签订合同时，双方可以选择在各自持有的合同上加盖公章或合同章。这种做法并不违反法律规定，只要双方对合同内容达成一致，且盖章行为真实、合法，合同即具有法律效力。

3. 需要注意的细节

• 合同内容一致性：无论使用公章还是合同章，双方持有的合同内容必须完全一致，避免出现因内容不一致而引发的纠纷。
• 盖章真实性：确保所盖的公章或合同章是真实有效的，避免使用伪造或过期的印章。
• 双方约定：如果双方在合同中明确约定了盖章方式或合同份数等事项，应严格按照约定执行。

4. 可能的法律后果

• 如果合同内容合法、双方意思表示真实且盖章行为有效：则合同具有法律效力，双方应按照合同约定履行各自义务。
• 如果合同内容存在违法情形、双方意思表示不真实或盖章行为无效：则合同可能被认定为无效或可撤销，双方可能面临法律责任和损失。

5. 实际操作建议

• 在签订合同时：建议双方明确约定合同份数、盖章方式等事项，并在合同中明确写明。
• 在盖章前：务必核对合同内容是否一致，确保盖章行为真实、合法。
• 在合同履行过程中：如遇到任何问题或纠纷，应及时咨询专业律师，以便及时维护自身合法权益。

总结：在签订合同时，甲乙双方各持一份合同并分别加盖公章和合同章的做法在法律上通常是可行的。但为了确保合同的合法性和有效性，建议双方在签订合同时明确约定相关事项，并在盖章前仔细核对合同内容。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。