学校在符合法律规定和劳动合同、规章制度约定的前提下，有权对考勤制度扣工资，但必须满足一系列条件，否则可能构成违法。以下从不同角度进行分析：
一、法律层面
《劳动法》与《劳动合同法》的相关规定：
- 根据《劳动法》和《劳动合同法》，用人单位（包括学校，如果其与员工构成劳动关系）有权制定规章制度来规范员工的行为，包括考勤制度。
- 但是，这些规章制度必须合法、合理，并且不得违反法律法规的强制性规定。同时，规章制度应当经过民主程序制定，并向员工公示或告知。
扣工资的合法性：
- 学校如果因为员工违反考勤制度而扣工资，必须确保这种扣减是合法的。合法扣减工资通常基于以下几种情况：员工因个人原因造成单位经济损失，且单位在规章制度中明确规定了赔偿方式；员工违反单位规章制度，且规章制度中明确规定了扣减工资作为处罚措施；或者双方在劳动合同中明确约定了相关条款。
- 如果学校没有合法依据或未按照法定程序制定规章制度，就随意扣减员工工资，那么这种行为是违法的。
二、实际操作层面
规章制度的具体内容：
- 学校应当制定明确、具体的考勤制度，包括迟到、早退、旷工等行为的定义和处罚措施。这些制度应当合理、公正，并且不得过于严苛或不合理。
- 规章制度中应当明确扣减工资的具体数额或比例，以及扣减工资的条件和程序。
执行过程中的注意事项：
- 学校在执行考勤制度时，应当确保公平、公正、公开。对于违反考勤制度的员工，应当按照规章制度进行处罚，并且处罚应当与违规行为的性质和情节相适应。
- 学校在扣减员工工资时，应当确保扣减的数额不超过员工当月工资的法定比例（如根据《工资支付暂行规定》，因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。经济损失的赔偿，可从劳动者本人的工资中扣除，但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%）。同时，扣减后的工资不得低于当地最低工资标准。
三、员工权益保护
- 如果员工认为学校的考勤制度或扣减工资行为违法或不合理，可以通过与学校协商、向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁等方式来维护自己的合法权益。
建议：
- 学校在制定和执行考勤制度时，应当严格遵守法律法规和劳动合同的约定，确保制度的合法性和合理性。
- 员工在签订劳动合同时，应当仔细阅读合同条款，特别是关于考勤和工资扣减的条款，确保自己的权益得到保障。
- 如果遇到问题或争议，建议及时咨询专业律师或相关机构，以便更好地维护自己的合法权益。
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