在职务犯罪案件中，若犯罪嫌疑人交代与同案人之间存在婚外男女朋友关系，司法机关会从以下几个角度进行处理：

1. 证据审查与关联性判断
   司法机关会首先审查该婚外关系是否与职务犯罪行为存在实质关联。若该关系被用于掩盖利益输送（如通过情人账户转移赃款）、共同实施犯罪（如利用情人身份获取内部信息），或存在权色交易等情形，则可能被认定为犯罪构成要件的一部分，直接影响定罪量刑。例如，若情人关系是行贿受贿的媒介，则可能构成受贿罪的共犯。

2. 量刑情节的考量
   若婚外关系与犯罪行为无直接关联，但反映出犯罪嫌疑人道德败坏、社会评价降低，可能作为量刑时的酌定从重情节。根据《刑法》第六十一条，量刑需综合考虑犯罪事实、性质、情节及社会危害程度，道德因素虽非法定量刑依据，但可能影响法官对犯罪嫌疑人主观恶性的判断。

3. 对案件侦破的影响
   若犯罪嫌疑人主动交代婚外关系，且该信息有助于司法机关突破案件（如通过情人关系锁定赃款去向或同案犯行踪），可能被认定为《刑法》第六十七条规定的“坦白”情节，从而获得从轻处罚。但若该关系此前已被司法机关掌握，或犯罪嫌疑人拒不交代其他核心犯罪事实，则坦白情节的认定会受到限制。

4. 隐私权与司法公开的平衡
   婚外关系属于个人隐私范畴，司法机关在侦查、审查起诉及审判阶段需严格保密，避免无关信息泄露。但在庭审阶段，若该关系与犯罪事实直接相关，可能成为公开审理的内容，此时犯罪嫌疑人需承担隐私权部分让渡的法律后果。

实务建议：
若您或您身边的人涉及此类情形，建议：

1. 全面梳理婚外关系与职务犯罪行为的关联性，避免因隐瞒关键信息导致法律风险升级；
   
2. 主动配合司法机关调查，但需谨慎对待无关问题的询问，防止被诱导作出不利陈述；
   
3. 及时委托专业律师介入，通过会见、阅卷等程序精准分析证据链条，制定辩护策略。
   

如有具体案件细节需要进一步分析，可直接向我咨询。