中草药中含有杀菌剂是否合法，需分情况讨论：
若杀菌剂属于合法添加成分且符合规定
- 合法性分析：如果中草药中添加的杀菌剂是经过国家相关部门批准，且添加量、使用范围等均符合相关法律法规和标准的要求，那么这种添加行为是合法的。例如，某些中草药在种植、加工过程中，为了防止霉变、虫害等，可能会使用一些低毒、高效的杀菌剂，但这些杀菌剂的使用必须严格遵守国家的相关规定。
- 法律依据：根据《中华人民共和国农产品质量安全法》等相关法律法规，农产品（包括中草药）的生产、加工、销售等环节，都必须遵守国家关于农产品质量安全的标准和要求。如果杀菌剂的使用符合这些标准和要求，那么就是合法的。
若杀菌剂属于非法添加成分或不符合规定
- 非法性分析：如果中草药中添加的杀菌剂是国家禁止使用的，或者添加量、使用范围等超过了相关法律法规和标准的要求，那么这种添加行为就是非法的。非法添加杀菌剂可能会对人体健康造成潜在危害，如引发过敏反应、中毒等。
- 法律后果：根据《中华人民共和国食品安全法》、《中华人民共和国刑法》等相关法律法规，非法添加禁用物质或者超量添加限用物质的，将面临严厉的法律处罚，包括罚款、没收违法所得、吊销许可证等，甚至可能构成犯罪，依法追究刑事责任。
建议与提醒：
- 对于生产者：应严格遵守国家关于中草药种植、加工、销售等环节的法律法规和标准要求，确保中草药的质量安全。在使用杀菌剂等农药时，应选择合法、低毒、高效的品种，并严格按照规定的用量和使用方法进行使用。
- 对于消费者：在购买中草药时，应选择正规渠道购买，注意查看产品的生产日期、保质期、生产厂家等信息，避免购买到非法添加杀菌剂等有害物质的中草药。如果发现中草药存在质量问题或者疑似非法添加的情况，应及时向相关部门举报。
若您在中草药质量安全方面遇到法律问题或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问，我将根据您的具体情况提供专业的法律建议。