结论：公司为员工购买商业险，并将公司自身指定为受益人，这一做法的合法性需分情况讨论，一般情况下，若员工同意，则合法；若未经员工同意，则可能不合法。以下从不同角度进行详细分析：
一、合法情况分析
员工同意并签署相关文件：
- 如果公司在为员工购买商业险时，明确告知了员工保险的具体内容、受益人指定为公司等关键信息，并且员工在充分了解并同意的情况下签署了相关文件，那么这种做法是合法的。
- 在这种情况下，员工作为被保险人，其同意是保险合同生效的重要前提。公司作为投保人，有权在符合法律法规和保险合同约定的前提下，指定自己为受益人。
符合保险合同约定：
- 保险合同是投保人与保险公司之间设立、变更、终止民事权利义务关系的协议。如果保险合同中明确约定了公司可以作为受益人，并且这一约定不违反法律法规的强制性规定，那么公司作为受益人就是合法的。
二、不合法情况分析
未经员工同意：
- 如果公司在为员工购买商业险时，未告知员工保险的具体内容、受益人指定为公司等关键信息，或者员工在不知情的情况下被指定为被保险人、公司被指定为受益人，那么这种做法可能构成违法。
- 在这种情况下，员工的知情权和选择权受到了侵害，保险合同的效力可能因此受到影响。
违反法律法规强制性规定：
- 根据相关法律法规的规定，某些类型的保险合同可能禁止或限制指定公司作为受益人。例如，在人身保险中，通常要求受益人与被保险人具有保险利益关系，如亲属关系、债权债务关系等。如果公司作为受益人与被保险人之间不存在这种关系，且法律法规明确禁止或限制此类指定，那么公司作为受益人就是不合法的。
- 此外，如果保险合同中的受益人指定条款违反了公序良俗原则或损害了社会公共利益，也可能被认定为无效。
三、法律建议
对于公司而言：
- 在为员工购买商业险时，应确保充分告知员工保险的具体内容、受益人指定等关键信息，并获得员工的明确同意。
- 仔细审查保险合同条款，确保受益人指定符合法律法规和保险合同约定。
- 避免将公司指定为与员工无保险利益关系的保险合同的受益人，以降低法律风险。
对于员工而言：
- 在签署保险合同前，应仔细阅读合同条款，了解保险的具体内容、受益人指定等关键信息。
- 如果对公司指定自己为被保险人、公司为受益人有异议，应及时与公司沟通并表达自己的意愿。
- 如发现公司未经自己同意擅自指定受益人或违反法律法规强制性规定，可依法维护自己的合法权益。
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