当转包合同被认定为无效时，其赔偿及后续处理需依据相关法律法规进行，以下是对此问题的详细解答：
一、合同无效的法律后果
首先，非法转包合同从签订之日起即不具有法律约束力，这是根据《民法典》第一百五十五条的规定。这意味着，双方基于该合同所产生的任何权利义务关系均视为自始不存在。因此，转包方不能依据此合同要求受让方支付工程价款，受让方也不能要求转包方承担违约责任。
二、财产返还与折价补偿
对于因非法转包合同取得的财产，应当予以返还。若财产无法返还或没有必要返还（如已完成的工程部分），则应进行折价补偿。在建设工程领域，如果受让方已经完成了部分转包工程，转包方需根据已完工程的实际价值，参照合同约定的计价方式，在扣除合理费用后支付给受让方相应的工程款。同时，如果转包方收取了受让方的预付款等，也应如数返还。
三、赔偿损失与连带赔偿责任
赔偿损失：根据《民法典》第一百五十七条及《建筑法》的相关规定，有过错的一方应赔偿对方因此受到的损失。在非法转包中，转包方通常承担主要过错责任。特别是当非法转包导致工程质量问题、工期延误等，给受让方或建设单位造成损失时，转包方需承担主要赔偿责任。
连带赔偿责任：如果转包工程存在质量问题并造成损失，转包人和接受转包的单位需共同承担赔偿责任。这是为了确保受害者的合法权益得到保障，防止责任方逃避法律责任。
四、工程款结算原则
当转包合同无效但工程质量合格时，工程款的结算需遵循以下原则：
参照合同约定结算：法院或仲裁机构通常会参照合同中关于工程价款的约定进行结算，以维护交易秩序和当事人的合理预期。双方应就已完成工程量及对应价款进行核算确认，必要时可通过司法鉴定确定工程造价。
考虑实际损失：若因合同无效导致一方遭受损失（如工期延误、质量缺陷等），责任方需承担赔偿责任。赔偿范围包括直接损失和可得利益损失，但需以实际发生且可预见为限。
扣除相关费用：发包人在支付工程款时，有权扣除已支付的预付款、进度款及其他应扣款项（如质保金）。若存在违约行为（如逾期完工），还可主张违约金抵扣。
利息计算：工程款利息自应付之日起算，利率标准按同期同类贷款利率或全国银行间同业拆借中心公布的贷款市场报价利率计付。
五、行政处罚与没收非法所得
除了民事法律后果外，非法转包行为还将面临严厉的行政处罚。根据《建筑法》第六十七条的规定，承包单位将承包的工程转包的，除责令改正、没收违法所得外，还可能受到罚款、责令停业整顿、降低资质等级等处罚。情节严重的，甚至可能被吊销资质证书。这些行政措施旨在维护公共利益和建筑市场的公平竞争。
综上所述，转包合同无效后的赔偿及处理涉及多个方面，包括财产返还、赔偿损失、工程款结算、行政处罚等。因此，在建筑工程领域，各方应严格遵守法律法规，坚决杜绝非法转包行为的发生，以维护建筑市场的健康有序发展。