针对您提出的问题，即一个自然人注册了个体户后，是否可以单独起诉该自然人，这主要取决于诉讼的具体情境和个体工商户的登记情况。

首先，我们需要明确的是，自然人从事工商业经营，经依法登记后，就成为了个体工商户。个体工商户在法律上是有其特定地位的，它既可以以个人名义经营，也可以起字号进行经营。

在诉讼中，关于诉讼主体的确定，有明确的规定：

1. 无字号的个体工商户：如果个体工商户没有起字号，那么在诉讼中，应以营业执照上登记的经营者，即该自然人，为当事人。但这种情况下的“单独起诉该自然人”，实际上是指起诉该个体工商户的经营者，而诉讼的实质是针对个体工商户的经营行为。不过，从形式上看，确实是直接起诉了该自然人（作为经营者）。但需注意，诉讼的焦点和责任承担是围绕个体工商户的经营活动。

2. 有字号的个体工商户：如果个体工商户起了字号，那么在诉讼中，应以营业执照上登记的字号为当事人，同时应注明该字号经营者的基本信息。在这种情况下，就不能单独起诉该自然人（作为经营者个人），而应该起诉该个体工商户的字号。如果同时需要追究实际经营者的责任，且登记经营者与实际经营者不一致，那么他们应作为共同诉讼人。

具体到您的问题：

• 如果您想要起诉的是与个体工商户相关的经营行为或债务等，且该个体工商户没有起字号，那么您可以起诉该自然人（作为经营者）。但诉讼的实质是针对个体工商户的经营活动。
• 如果该个体工商户起了字号，那么您应该起诉该字号，而不是单独起诉该自然人。除非在特定情况下，如需要同时追究实际经营者的责任，且登记经营者与实际经营者不一致，此时他们应作为共同诉讼人。

建议：

在准备起诉前，请务必确认个体工商户的登记情况（是否有字号）以及您想要追究的责任主体。如果不确定如何确定诉讼主体或如何准备诉讼材料，建议咨询专业的法律人士或律师，以确保您的诉讼行为符合法律规定，并有效维护您的合法权益。