在法院审理案件过程中，若发现双方违反招投标法，是否可以没收保证金，需视具体情况而定，不能一概而论。以下从不同角度进行分析：
一、保证金没收的一般原则
保证金通常作为投标人或中标人履行招投标程序及合同义务的一种担保。根据《中华人民共和国招标投标法》及相关规定，保证金的处理一般遵循以下原则：
- 若投标人或中标人无违约行为：保证金应在招标人与中标人签订合同后的一定期限内（如5日内）予以退还。
- 若投标人或中标人存在违约行为：如中标人无正当理由不与招标人签订合同，或投标人在投标有效期内撤回投标文件等，招标人有权没收其投标保证金。
二、违反招投标法与保证金没收的关系
直接违反招投标法的行为：
- 如果投标人或中标人的行为直接违反了《中华人民共和国招标投标法》的具体条款，如串通投标、弄虚作假等，且这些行为导致了招投标活动的无效或合同无法履行，招标人或法院有权根据法律规定和合同约定，决定是否没收保证金。
- 例如：若投标人通过串通投标的方式中标，且该行为被法院认定，那么招标人不仅有权取消其中标资格，还可能根据合同约定或法律规定没收其投标保证金。
间接影响招投标活动的行为：
- 有些行为可能并不直接违反《中华人民共和国招标投标法》的明确条款，但影响了招投标活动的公平、公正或诚实信用原则。在这种情况下，是否没收保证金可能需要根据具体案情、合同约定以及法院的裁量权来判断。
- 例如：若投标人在投标文件中提供了不真实的信息，但该信息并未直接影响中标结果，且投标人后续能够纠正或解释，那么法院可能不会直接没收其保证金，而是会要求其承担其他相应的法律责任。
三、法院的角色与裁量权
- 法院的审查权：在审理案件过程中，法院有权对招投标活动的合法性进行审查，包括审查是否存在违反招投标法的行为。
- 裁量权的行使：若法院认定存在违反招投标法的行为，且该行为与保证金的没收有直接关联，法院将根据法律规定、合同约定以及案件具体情况，行使裁量权决定是否没收保证金。
四、建议与注意事项
- 仔细审查合同条款：在参与招投标活动时，投标人应仔细审查招标文件中的保证金条款，了解保证金的具体金额、退还条件及没收情形等。
- 遵守招投标法规：投标人应严格遵守《中华人民共和国招标投标法》及相关规定，避免任何可能影响招投标活动公平、公正或诚实信用原则的行为。
- 及时咨询专业律师：若投标人在招投标过程中遇到法律问题或争议，应及时咨询专业律师，以便更好地维护自身合法权益。
若您在招投标过程中遇到保证金被没收或相关法律问题，可以直接向我咨询，我将根据您的具体情况提供专业的法律建议。