招标单位发函没收保证金，不可以不理。 针对这一问题，我将从法律后果、应对策略以及实际操作建议三个角度进行详细分析。

法律后果

首先，从法律角度来看，保证金在招标活动中通常作为投标人履行招标文件规定义务的担保。如果招标单位发函没收保证金，这通常意味着招标单位认为投标人存在违约行为，如未按照招标文件要求提交投标文件、未在规定时间内签订合同等。根据《中华人民共和国招标投标法》及相关规定，招标单位有权在特定情况下没收保证金。若投标人对此不予理会，可能会面临以下法律后果：

1. 保证金被没收：招标单位有权按照招标文件和相关法律规定，没收投标人的保证金。
2. 承担违约责任：如果投标人的违约行为给招标单位造成了损失，招标单位还有权要求投标人承担相应的违约责任，包括赔偿损失等。
3. 影响信用记录：在招标活动中，投标人的信用记录至关重要。不理会招标单位的没收保证金函件，可能会对投标人的信用记录产生不良影响，进而影响其未来参与招标活动的资格。

应对策略

面对招标单位发函没收保证金的情况，投标人应采取以下应对策略：

1. 及时沟通：首先，投标人应尽快与招标单位取得联系，了解没收保证金的具体原因和依据。通过沟通，可以澄清误解，避免不必要的法律纠纷。
2. 审查招标文件：投标人应仔细审查招标文件，确认自己是否存在违约行为。如果认为招标单位的没收行为缺乏依据，可以提出异议。
3. 寻求法律援助：如果投标人与招标单位无法就保证金问题达成一致，可以寻求专业律师的法律援助。律师可以帮助投标人分析法律风险，提供法律意见，并协助处理相关法律事务。

实际操作建议

在实际操作中，投标人可以采取以下措施来应对招标单位发函没收保证金的情况：

1. 保留相关证据：投标人应保留与招标活动相关的所有证据，包括招标文件、投标文件、中标通知书、合同等。这些证据在后续的法律纠纷中可能起到关键作用。
2. 及时回复函件：投标人应在收到招标单位的没收保证金函件后，及时回复并表明自己的立场和态度。避免因为拖延时间而错过解决问题的最佳时机。
3. 考虑协商解决：在可能的情况下，投标人可以与招标单位协商解决保证金问题。通过协商，双方可以达成一致意见，避免法律纠纷的发生。

综上所述，招标单位发函没收保证金时，投标人不可以不理。投标人应积极应对，通过及时沟通、审查招标文件、寻求法律援助等方式来维护自己的合法权益。如果有任何法律问题或需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询。