结论前置：协议书不追究对方刑事责任，并不意味着案件一定不会进入法院程序。是否上法院，取决于多种因素，包括案件的性质、双方当事人的意愿、证据情况以及法律程序的要求等。

详细分析：

1. 协议书的性质与效力：

   • 协议书是双方当事人就某一事项达成的共识，并书面记录下来的文件。在刑事案件中，如果双方当事人（通常是受害人和犯罪嫌疑人或被告人）就赔偿、谅解等事项达成协议，并签署了不追究对方刑事责任的协议书，这通常被视为一种民事和解或刑事和解的尝试。
   • 然而，协议书本身并不具有直接决定案件是否进入法院程序的法律效力。刑事案件的审理和判决是由国家司法机关（如检察院、法院）根据法律规定和证据情况来决定的，而不是由双方当事人的协议来决定的。

2. 案件是否上法院的因素：

   • 案件性质：如果案件涉及严重的犯罪行为，如暴力犯罪、经济犯罪等，即使双方当事人达成了协议书，检察院仍可能依法提起公诉，案件将进入法院审理程序。
   • 双方当事人意愿：虽然双方当事人可能达成了不追究刑事责任的协议，但如果检察院认为案件性质严重，或者存在其他需要追究刑事责任的情形，仍可能坚持提起公诉。
   • 证据情况：如果证据充分，能够证明犯罪嫌疑人的犯罪行为，那么即使双方当事人达成了协议书，案件也可能进入法院审理程序。
   • 法律程序要求：在某些情况下，法律可能规定某些类型的案件必须经过法院审理才能结案，无论双方当事人是否达成协议。

3. 协议书在法院审理中的作用：

   • 如果案件进入法院审理程序，协议书可以作为双方当事人和解的证据之一，供法院参考。法院在审理案件时，会综合考虑各种因素，包括协议书的内容、双方当事人的意愿、证据情况等，来作出判决。
   • 如果协议书内容合法、有效，且符合法律规定和公序良俗，法院可能会在判决时予以考虑，如减轻犯罪嫌疑人的刑罚等。

建议与提醒：

• 如果您或他人涉及刑事案件，并签署了不追究对方刑事责任的协议书，建议咨询专业律师以了解案件的具体情况和法律程序要求。
• 协议书虽然可以在一定程度上反映双方当事人的意愿和和解态度，但并不能直接决定案件是否进入法院程序或判决结果。因此，在签署协议书时，应谨慎考虑并咨询专业律师的意见。

如有任何法律疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供专业的法律建议。