核心结论：项目未开工且未办理施工许可证的情况下变更项目经理，需分情况处理，主要涉及向建设主管部门说明情况并履行变更手续，同时需关注合同约定及内部管理要求。以下是具体分析：

1. 从行政许可与备案角度
   根据《建筑工程施工许可管理办法》及各地实施细则，施工许可证的申请需明确项目经理信息。若项目尚未办理施工许可证，理论上变更项目经理无需直接向建设主管部门申请变更施工许可证（因许可证尚未核发），但需注意：

   • 部分地区要求在施工许可证申请材料中提前锁定项目经理信息，此时若需变更，需重新提交包含新项目经理资质（如建造师证书、安全生产考核合格证等）的申请材料，并说明变更原因（如原项目经理离职、健康原因等）。
     
   • 若项目已提交施工许可证申请但未获批，变更项目经理可能需撤回原申请，重新按新项目经理信息申报，避免后续审批因信息不一致被驳回。

2. 从合同与内部管理角度

   • 与建设单位（业主）的合同：若施工合同中已约定项目经理姓名及职责（如《建设工程施工合同（示范文本）》GF-2017-0201第3.2.1条），变更项目经理需经建设单位书面同意，否则可能构成违约，需承担违约金或赔偿损失。
     
   • 与项目经理的劳动关系：若原项目经理系公司员工，需按《劳动合同法》解除或变更劳动合同（如协商一致、支付经济补偿等）；若系外部挂靠，需清理挂靠关系，避免法律风险（如挂靠协议无效、行政处罚等）。
     
   • 内部审批流程：需按公司章程或项目管理制度履行变更审批，如召开董事会/总经理办公会决议，更新项目部印章、文件授权等。

3. 从风险防范角度

   • 证据留存：变更过程中需留存书面文件（如变更申请表、建设单位同意函、劳动合同解除证明等），避免后续纠纷。
     
   • 公告与通知：向监理单位、分包单位、材料供应商等第三方公告项目经理变更信息，确保项目衔接顺畅。
     
   • 资质核查：确保新项目经理具备相应资质（如一级/二级建造师注册证书、安全生产考核B证），避免因资质不符导致施工许可证无法办理或项目停工。

建议行动步骤：

1. 核查项目所在地建设主管部门对施工许可证申请中项目经理变更的具体要求（如是否需重新申报、是否需现场核查等）；
   
2. 与建设单位协商并取得书面同意变更项目经理的文件；
   
3. 完成原项目经理的劳动关系处理及新项目经理的资质审核与任命；
   
4. 按要求更新施工许可证申请材料（如需）或提交变更备案；
   
5. 内部公告变更信息并完成项目交接。
   

如有进一步疑问（如具体地区政策、合同条款解读等），可直接向我咨询。