供应商确实可以和总公司、分公司分开签订协议，但具体是否可行及需要注意的事项，需从以下几个角度进行分析：

1. 法律主体独立性角度

   • 总公司和分公司虽然存在关联关系，但在法律上，分公司并不具备独立的法人资格，其民事责任由总公司承担。然而，这并不妨碍供应商与分公司单独签订协议。分公司可以在其经营范围内，以自己的名义从事民事活动，包括签订合同。因此，从法律主体独立性的角度来看，供应商与总公司、分公司分开签订协议是可行的。

2. 合同效力与履行角度

   • 供应商与分公司签订的协议，只要内容合法、双方意思表示真实，且不违反法律、行政法规的强制性规定，该协议即具有法律效力。分公司作为合同的一方，应当按照协议约定履行义务。若分公司无法履行或履行不符合约定，供应商有权要求总公司承担相应的责任，因为分公司的民事责任最终由总公司承担。
   • 同时，供应商与总公司签订的协议，同样需要满足合同生效的要件，且总公司作为独立的法人主体，应当独立承担合同责任。若供应商与总公司、分公司分别签订了涉及同一事项的协议，需注意协议之间的协调性和一致性，避免产生法律冲突。

3. 实际操作与风险防范角度

   • 在实际操作中，供应商与总公司、分公司分开签订协议时，应明确各方的权利义务关系，避免产生歧义或纠纷。例如，可以在协议中明确约定分公司的授权范围、总公司的担保责任等。
   • 供应商还应关注分公司的经营状况和财务状况，确保分公司具备履行协议的能力。若分公司出现经营异常或财务危机，供应商应及时与总公司沟通，寻求解决方案。
   • 此外，供应商在签订协议时，应仔细审查协议条款，确保协议内容合法、合规，并充分考虑可能出现的风险点，制定相应的风险防范措施。

建议：

• 供应商在与总公司、分公司分开签订协议时，应充分了解各方的法律地位和责任承担方式，确保协议内容合法、合规且明确各方权利义务。
• 供应商应关注分公司的经营状况和财务状况，及时与总公司沟通，确保协议的顺利履行。
• 若供应商对协议条款或法律风险存在疑问，建议直接向我咨询，以便获得更专业、更全面的法律建议。