运输企业因违法被行政处罚的次数并不是直接决定其是否会被追究刑事责任的关键因素，是否追究刑事责任主要取决于违法行为的性质、情节以及是否构成犯罪。以下从不同角度进行详细分析：
违法行为性质与情节：
- 运输企业的违法行为，如果仅仅是一般的违规行为，如超载、超速等，且情节轻微，通常只会受到行政处罚，如罚款、扣分、吊销驾驶证等，而不会直接追究刑事责任。
- 如果运输企业的违法行为涉及严重危害公共安全、人身安全或财产安全，如非法运输危险物质、严重超载导致重大交通事故等，且情节严重，那么就可能构成犯罪，需要追究刑事责任。
行政处罚与刑事责任的衔接：
- 行政处罚和刑事责任是两种不同的法律责任形式，它们之间并不存在直接的“次数”关系。即，不是因为被行政处罚了多少次就一定会被追究刑事责任。
- 在某些情况下，运输企业可能因多次违法而受到行政处罚，但如果这些违法行为并未达到犯罪的程度，那么就不会追究刑事责任。反之，如果一次违法行为就构成了犯罪，那么即使之前没有受到过行政处罚，也需要追究刑事责任。
具体案例与法律规定：
- 以非法运输危险物质为例，根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，非法运输危险物质，危害公共安全的，处三年以上十年以下有期徒刑；情节严重的，处十年以上有期徒刑、无期徒刑或者死刑。这里并没有规定必须达到多少次行政处罚才会追究刑事责任，而是看违法行为的性质和情节。
- 再比如，运输企业严重超载导致重大交通事故的，也可能构成交通肇事罪或危险驾驶罪等，需要追究刑事责任。这同样不是基于行政处罚的次数，而是基于违法行为的后果和情节。
建议：
- 运输企业应严格遵守相关法律法规，确保运输活动的合法性和安全性，避免违法行为的发生。
- 如果运输企业因违法行为受到行政处罚，应认真对待，及时整改，防止类似行为再次发生。
- 如果运输企业的违法行为可能构成犯罪，或者已经涉嫌犯罪，应及时向专业律师咨询，了解法律后果和应对策略。
总结来说，运输企业因违法被行政处罚的次数并不是决定其是否会被追究刑事责任的关键因素。是否追究刑事责任主要取决于违法行为的性质、情节以及是否构成犯罪。因此，运输企业应注重合规经营，避免违法行为的发生，以维护自身的合法权益和社会的公共安全。如有任何法律疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。