农业灌溉收取个人电损耗费用是否合法，需分情况讨论：

1. 若电损耗费用已包含在灌溉水费中：

   • 根据《中华人民共和国价格法》及相关农业用水收费规定，农业灌溉水费通常应包含基本水价和计量水价，其中可能已涵盖了合理的电损耗等成本。若当地政府或相关部门已明确规定了灌溉水费的构成，且电损耗费用已合理计入其中，则再单独收取个人电损耗费用则不合法。这种情况下，用户有权拒绝支付额外费用，并可向当地物价部门或农业部门投诉。

2. 若电损耗费用未包含在灌溉水费中，且经合法程序确定：

   • 在某些特殊情况下，如灌溉系统老化、设备损耗大等，导致电损耗费用显著增加，且这部分费用未在原灌溉水费中体现。此时，若经过村民会议或村民代表会议等合法程序讨论决定，并报经相关部门批准后，可以合理收取电损耗费用。但这种情况下，收费标准应公开透明，且不得超过实际发生的电损耗成本。

3. 若未经合法程序擅自收取：

   • 无论电损耗费用是否包含在灌溉水费中，若未经村民会议或村民代表会议等合法程序讨论决定，也未经相关部门批准，擅自收取个人电损耗费用则属于违法行为。用户有权拒绝支付，并可向当地相关部门举报，要求查处这种违法行为。

法律建议：

• 对于用户而言，首先应了解当地农业灌溉水费的构成及收费标准，确认电损耗费用是否已包含在内。
• 若认为收费不合理或存在违法行为，可向当地物价部门、农业部门或村民委员会等机构咨询或投诉。
• 在处理此类纠纷时，建议保留好相关证据，如收费通知、缴费凭证等，以便在需要时维护自己的合法权益。

可能后果：

• 若擅自收取电损耗费用被查处，相关部门可能会责令退还非法收取的费用，并对责任人进行处罚。
• 对于用户而言，若拒绝支付合法合理的电损耗费用，可能会面临灌溉服务中断等风险。因此，在处理此类问题时，应理性对待，通过合法途径解决纠纷。

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